47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2319 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  100 
 
 		 572 aa  1165    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  53.16 
 
 		 556 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  50.79 
 
 		 558 aa  599  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  52.44 
 
 		 555 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  54.61 
 
 		 542 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  47.74 
 
 		 566 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  48.73 
 
 		 566 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  49.55 
 
 		 549 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.61 
 
 		 562 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.64 
 
 		 561 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.28 
 
 		 561 aa  507  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.01 
 
 		 561 aa  505  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.37 
 
 		 548 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.21 
 
 		 543 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.36 
 
 		 548 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.37 
 
 		 548 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  47.19 
 
 		 543 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  45.31 
 
 		 548 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.92 
 
 		 552 aa  372  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  36.71 
 
 		 566 aa  354  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  33.45 
 
 		 566 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  34.51 
 
 		 570 aa  329  9e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  32.98 
 
 		 568 aa  326  7e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  32.43 
 
 		 583 aa  324  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  33.57 
 
 		 567 aa  323  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.57 
 
 		 567 aa  323  6e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  32.87 
 
 		 567 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  30.86 
 
 		 583 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  31.06 
 
 		 583 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  30.86 
 
 		 583 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  34.15 
 
 		 578 aa  317  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  33.8 
 
 		 568 aa  317  5e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  31.94 
 
 		 582 aa  317  5e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  33.56 
 
 		 566 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.45 
 
 		 570 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  33.04 
 
 		 567 aa  311  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.85 
 
 		 569 aa  310  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  31.88 
 
 		 571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  32.31 
 
 		 565 aa  302  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  31.79 
 
 		 570 aa  296  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  33.33 
 
 		 566 aa  292  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  29.53 
 
 		 597 aa  289  8e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  29.85 
 
 		 584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  31.26 
 
 		 584 aa  279  8e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  38.71 
 
 		 485 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  38.71 
 
 		 485 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  38.71 
 
 		 485 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>