More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf326 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf326  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
101 aa  200  6e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.858976  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0412  50S ribosomal protein L21  58.76 
 
 
100 aa  110  9e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  54.17 
 
 
100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1326  50S ribosomal protein L21P  54.17 
 
 
99 aa  108  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000107304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  54.74 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  54.74 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  54.74 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  54.74 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  54.74 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  54.74 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  54.74 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  54.74 
 
 
102 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  52.48 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  54 
 
 
102 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  53 
 
 
102 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  53.68 
 
 
102 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  53.68 
 
 
102 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  53.68 
 
 
102 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 
104 aa  101  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  48.04 
 
 
103 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
104 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl441  50S ribosomal protein L21  53.61 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  98.6  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  49 
 
 
102 aa  98.2  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  42.31 
 
 
104 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  50 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1211  50S ribosomal protein L21  51 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000816286  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0205  50S ribosomal protein L21  46.39 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1737  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000015429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1704  50S ribosomal protein L21  52 
 
 
102 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000276664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  46.08 
 
 
105 aa  94.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  49.5 
 
 
132 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  48.48 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  46.46 
 
 
104 aa  92.8  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  44.79 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
105 aa  89  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  48 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  44.9 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  44.79 
 
 
104 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
124 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
106 aa  87  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  44 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  43.3 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  44.33 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  43.62 
 
 
100 aa  84.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  42.27 
 
 
102 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  42.27 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  42.27 
 
 
188 aa  84  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
104 aa  83.2  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  44.68 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  40.95 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  38.61 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  42 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  43 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  39.8 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  40.59 
 
 
223 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
102 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  36.63 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  41 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  43.56 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  35.64 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  39.22 
 
 
104 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109341  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  43 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  37.62 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 
103 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  41.58 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  38.24 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>