More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00965 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00965  putative flagellin  100 
 
 
449 aa  900    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.007808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0811  flagellin  33.62 
 
 
491 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  34.39 
 
 
462 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  32.61 
 
 
469 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  31.84 
 
 
467 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  33.26 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  32.99 
 
 
488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  32.76 
 
 
437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  31.92 
 
 
394 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  31.78 
 
 
393 aa  136  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  31.91 
 
 
431 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  31.06 
 
 
387 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  30.24 
 
 
420 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  30.38 
 
 
502 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  30.19 
 
 
505 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  32.1 
 
 
384 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  32.1 
 
 
384 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  54.69 
 
 
294 aa  123  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  58.41 
 
 
497 aa  123  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  57.39 
 
 
580 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  29.66 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  41.38 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  51.82 
 
 
517 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  58.26 
 
 
485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  30.94 
 
 
502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  58.26 
 
 
468 aa  120  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  40 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  52.5 
 
 
475 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  52.34 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  57.39 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  51.67 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  59.81 
 
 
276 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  55.08 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  56.03 
 
 
492 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  53.28 
 
 
587 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  29.93 
 
 
404 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  54.31 
 
 
609 aa  117  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  56.9 
 
 
490 aa  117  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  55.17 
 
 
493 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  30.14 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  56.9 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  55.65 
 
 
492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  48.91 
 
 
272 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  50.39 
 
 
283 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  58.49 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  47.83 
 
 
384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  55.17 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  54.31 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  54.1 
 
 
272 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  44.71 
 
 
471 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  54.1 
 
 
272 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  54.31 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  29.3 
 
 
383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  49.64 
 
 
687 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  48.18 
 
 
276 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  47.83 
 
 
384 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  55.05 
 
 
282 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  56.14 
 
 
481 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  55.46 
 
 
492 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  51.26 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  61.05 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  54.37 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  57.55 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  57.14 
 
 
494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  55.17 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  49.22 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  50.36 
 
 
280 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  53.39 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  37.76 
 
 
377 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  51.56 
 
 
319 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  53.28 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  53.28 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  37.76 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  53.28 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  53.28 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  54.78 
 
 
271 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  53.91 
 
 
388 aa  110  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  54.78 
 
 
271 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  50.37 
 
 
272 aa  110  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  49.15 
 
 
281 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  52.03 
 
 
380 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  54.39 
 
 
482 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  51.3 
 
 
272 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  52.59 
 
 
492 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  51.72 
 
 
379 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  53.91 
 
 
273 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  49.28 
 
 
273 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  53.91 
 
 
273 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  48.46 
 
 
271 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
271 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  56.44 
 
 
376 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  50 
 
 
404 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  52.17 
 
 
378 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  51.3 
 
 
271 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  51.3 
 
 
271 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  49.22 
 
 
282 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  48.31 
 
 
281 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  49.28 
 
 
273 aa  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  52.54 
 
 
273 aa  107  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>