More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0811 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0811  flagellin  100 
 
 
491 aa  996    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00965  putative flagellin  33.62 
 
 
449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.007808  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  29.52 
 
 
505 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  30.6 
 
 
437 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  29.53 
 
 
505 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  53.57 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  37.38 
 
 
404 aa  130  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  38.69 
 
 
276 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  45.05 
 
 
471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  42.53 
 
 
475 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  45.71 
 
 
580 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  26.17 
 
 
488 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  41.95 
 
 
475 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  47.14 
 
 
493 aa  126  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  43.9 
 
 
462 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  47.14 
 
 
490 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  48.95 
 
 
497 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  27.08 
 
 
513 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  47.86 
 
 
405 aa  123  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  46.43 
 
 
501 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  47.14 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  46.53 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  49.29 
 
 
395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  49.29 
 
 
392 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  48.61 
 
 
609 aa  121  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  42.66 
 
 
282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  41.21 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  47.14 
 
 
431 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  47.14 
 
 
280 aa  118  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  45 
 
 
506 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  42.86 
 
 
687 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  45 
 
 
492 aa  117  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  43.54 
 
 
587 aa  117  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  44.37 
 
 
279 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  45 
 
 
492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  48.57 
 
 
486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  44.37 
 
 
279 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  44.6 
 
 
278 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  42.68 
 
 
469 aa  114  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  40.85 
 
 
286 aa  113  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  40.97 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  42.86 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  41.13 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  45.45 
 
 
506 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  45.45 
 
 
502 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  45.45 
 
 
506 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  45.45 
 
 
506 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  45.45 
 
 
493 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  36.18 
 
 
272 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  40.85 
 
 
287 aa  109  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  32.86 
 
 
282 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  44.29 
 
 
288 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  45.14 
 
 
488 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  41.43 
 
 
482 aa  109  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  35.68 
 
 
272 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  43.36 
 
 
579 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1053  flagellin  43.36 
 
 
568 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  45.99 
 
 
278 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  41.46 
 
 
492 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  43.36 
 
 
545 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  39.29 
 
 
483 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  36.78 
 
 
376 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2698  flagellin  43.36 
 
 
585 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.132656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  36.82 
 
 
274 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  44.76 
 
 
506 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  42.75 
 
 
271 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0198  flagellin-like protein  41.84 
 
 
936 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  42.75 
 
 
271 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  34.48 
 
 
385 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  42.54 
 
 
314 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  39.29 
 
 
283 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  36.21 
 
 
376 aa  106  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  40 
 
 
290 aa  106  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  42.03 
 
 
272 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  42.03 
 
 
272 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  40 
 
 
485 aa  106  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  33.47 
 
 
287 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2022  putative flagellin  45.71 
 
 
349 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  41.43 
 
 
492 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  38.57 
 
 
387 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  34.51 
 
 
379 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  45.52 
 
 
412 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  40.11 
 
 
283 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  44.03 
 
 
284 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  44.37 
 
 
373 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  41.3 
 
 
271 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  41.3 
 
 
271 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  38.57 
 
 
377 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  38.57 
 
 
377 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  41.3 
 
 
271 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  41.3 
 
 
271 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  38.57 
 
 
484 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  44.29 
 
 
498 aa  104  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1716  flagellin  42.66 
 
 
572 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  42.03 
 
 
276 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  44.44 
 
 
369 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  39.72 
 
 
393 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  44.44 
 
 
369 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  34.66 
 
 
377 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  34.66 
 
 
377 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>