195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4707 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4707  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  206  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  91.14 
 
 		 301 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  91.14 
 
 		 301 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  74.68 
 
 		 301 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  73.42 
 
 		 301 aa  115  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  70.89 
 
 		 301 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  70.89 
 
 		 301 aa  114  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  69.23 
 
 		 228 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  67.95 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03920  ISPsy21, transposase OrfB  67.95 
 
 		 170 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.67034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  70.89 
 
 		 301 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  70.89 
 
 		 301 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  67.09 
 
 		 301 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  65.82 
 
 		 299 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  65.82 
 
 		 299 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  73.42 
 
 		 185 aa  102  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  64.56 
 
 		 218 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3889  hypothetical protein  61.45 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  60.76 
 
 		 301 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  60.76 
 
 		 301 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7786  hypothetical protein  77.59 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0016591  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1795  transposase  55.7 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.246406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  85.5  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  55.7 
 
 		 296 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  54.43 
 
 		 296 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  55.13 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  55.13 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  55.13 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  55.13 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  55.13 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  55.13 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  55.13 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  55.13 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  51.9 
 
 		 304 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  50.63 
 
 		 304 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  50.63 
 
 		 304 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  51.9 
 
 		 303 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  53.16 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  53.16 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  53.16 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  53.16 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  53.16 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  53.16 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  53.16 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  53.16 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  58.33 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  53.85 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1630  hypothetical protein  60.29 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  50.63 
 
 		 183 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15130  transposase  46.74 
 
 		 304 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0124781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  54.67 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  58.23 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  58.23 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  58.23 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  58.23 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  57.89 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  57.89 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  56 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  56 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  56 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2446  Integrase catalytic region  40.7 
 
 		 312 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000102431  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2523  Integrase catalytic region  41.67 
 
 		 312 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011837  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3288  Integrase catalytic region  43.82 
 
 		 320 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1220  Integrase catalytic region  40.7 
 
 		 312 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1224  Integrase catalytic region  40.7 
 
 		 312 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.401317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2390  hypothetical protein  72.22 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4732  Integrase catalytic region  40.48 
 
 		 309 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2169  Integrase catalytic region  40.48 
 
 		 309 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2615  Integrase catalytic region  40.48 
 
 		 309 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2811  Integrase catalytic region  40.48 
 
 		 309 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.675485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3614  Integrase catalytic region  40.48 
 
 		 309 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4663  Integrase catalytic region  40.48 
 
 		 309 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4701  Integrase catalytic region  40.48 
 
 		 309 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3430  Integrase catalytic region  40.96 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  50.88 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  50.88 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  50.88 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  50.88 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  38.46 
 
 		 295 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  38.46 
 
 		 295 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  38.46 
 
 		 295 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  38.46 
 
 		 295 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>