More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2523 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2523  Integrase catalytic region  100 
 
 		 312 aa  641    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011837  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1224  Integrase catalytic region  94.87 
 
 		 312 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.401317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1220  Integrase catalytic region  94.87 
 
 		 312 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2446  Integrase catalytic region  93.59 
 
 		 312 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000102431  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4663  Integrase catalytic region  62.01 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4732  Integrase catalytic region  62.01 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2811  Integrase catalytic region  62.01 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.675485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4701  Integrase catalytic region  62.01 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3614  Integrase catalytic region  62.01 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2169  Integrase catalytic region  62.01 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2615  Integrase catalytic region  62.01 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3430  Integrase catalytic region  61.36 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2895  Integrase catalytic region  58.6 
 
 		 312 aa  346  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3301  Integrase catalytic region  58.6 
 
 		 312 aa  346  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15130  transposase  49.5 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0124781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  48.53 
 
 		 311 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1204  Integrase catalytic region  51.05 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  48.22 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  48.22 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  50 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  50 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  50 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  48 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  49.84 
 
 		 303 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  48.03 
 
 		 301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  48.03 
 
 		 301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  45.98 
 
 		 301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  46.23 
 
 		 301 aa  245  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  46.93 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  44.44 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  44.44 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  48.04 
 
 		 304 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  45.03 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  45.33 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  45.33 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  45.33 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  46.91 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  48.07 
 
 		 278 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  238  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  45.33 
 
 		 295 aa  238  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  45 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  46.53 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  45.07 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  45.07 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  47.73 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  45.12 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  45.12 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  45.12 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  44.67 
 
 		 296 aa  235  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  45.12 
 
 		 301 aa  235  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  45 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  44.67 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  44.67 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  48.15 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  47.93 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  47.93 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>