More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1511 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1511  ABC transporter related  100 
 
 		 246 aa  503  9.999999999999999e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1936  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  75.31 
 
 		 245 aa  385  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0352158  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1634  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  69.83 
 
 		 251 aa  352  4e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  68.18 
 
 		 258 aa  342  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.3 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  61.07 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.29 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 256 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  57.38 
 
 		 242 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  56.97 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  57.14 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  56.97 
 
 		 242 aa  288  6e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 		 270 aa  288  8e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.89 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  54.69 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  60.17 
 
 		 248 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  55.92 
 
 		 243 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  56.97 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  57.38 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1932  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  55.33 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.74 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  54.32 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  55.74 
 
 		 259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.56 
 
 		 244 aa  280  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  56.33 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  54.1 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  55.69 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  54.69 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 252 aa  280  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  53.91 
 
 		 242 aa  278  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 257 aa  278  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  54.13 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  54.13 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  54.13 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.13 
 
 		 252 aa  278  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  55.28 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  56.02 
 
 		 242 aa  278  8e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0892  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  56.02 
 
 		 242 aa  278  8e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.495443  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  56.02 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  54.32 
 
 		 242 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  53.09 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  54.69 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  55.33 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  53.91 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  53.91 
 
 		 263 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  55.33 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  55.6 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  53.09 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.92 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.02 
 
 		 239 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  55.33 
 
 		 242 aa  276  3e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.03 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  53.5 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  56.43 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  53.88 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  55.33 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  56.02 
 
 		 241 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  55.19 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  52.96 
 
 		 259 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  53.28 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  54.51 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  53.88 
 
 		 255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  55.74 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  51.03 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  53.06 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  54.36 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.6 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  54.36 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  52.24 
 
 		 259 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  53.47 
 
 		 244 aa  272  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  52.89 
 
 		 246 aa  272  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  55.1 
 
 		 252 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  53.53 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0815  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  53.09 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0779  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  57.68 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1189  ABC transporter related  57.68 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  55.33 
 
 		 260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0766  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  53.94 
 
 		 244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  53.06 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  52.46 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0705  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  53.72 
 
 		 252 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 251 aa  271  5.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  53.28 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  52.46 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  55.93 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.47 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  54.85 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>