More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0502 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0502  aminotransferase, class V  100 
 
 		 382 aa  788    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000217795  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1224  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  56.32 
 
 		 384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0450  aminotransferase (class V), putative  53.42 
 
 		 381 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0570589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0534  pyridoxal-phosphate dependent aminotransferase  53.68 
 
 		 381 aa  402  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1373  cysteine desulphurase  50.79 
 
 		 381 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00618105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3320  aminotransferase class V  50 
 
 		 380 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4479  aminotransferase class V  48.68 
 
 		 380 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4785  aminotransferase, class V  48.41 
 
 		 380 aa  358  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4546  aminotransferase, class V  48.41 
 
 		 380 aa  358  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4783  aminotransferase, class V  48.41 
 
 		 380 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4382  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  48.41 
 
 		 380 aa  358  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4900  aminotransferase, class V  48.41 
 
 		 380 aa  358  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4392  cysteine desulfhydrase, aminotransferase, class V  48.41 
 
 		 380 aa  358  9e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4766  aminotransferase, class V  48.15 
 
 		 380 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4757  aminotransferase, class V  48.15 
 
 		 380 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  50.69 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0478  aminotransferase, class V  48.15 
 
 		 380 aa  353  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000122406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  49.17 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  44.23 
 
 		 383 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  43.35 
 
 		 381 aa  288  8e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  41.55 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  41.4 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  41.84 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  40.91 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  40.9 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  41.58 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1403  aminotransferase, class V  41.26 
 
 		 381 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.862736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  41.32 
 
 		 400 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  40.79 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  42.35 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  41.05 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1667  aminotransferase, class V  40.98 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  39.11 
 
 		 394 aa  272  9e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  40.82 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  40.93 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  37.34 
 
 		 395 aa  270  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  38.16 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  40.25 
 
 		 409 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.01 
 
 		 388 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1099  aminotransferase class V  40.42 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.386639  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  38.06 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0988  cysteine desulfurase  39.47 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  40 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1142  cysteine desulfurase  39.73 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.165458  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  40.37 
 
 		 395 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  39.26 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  42.08 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  38.95 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  40.44 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  37.6 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.36 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  38.58 
 
 		 384 aa  256  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  38.06 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  37.8 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  37.8 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  38.21 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  39.47 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  38.26 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  38.44 
 
 		 388 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.68 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  37.37 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.67 
 
 		 414 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.62 
 
 		 381 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  38.52 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  40.27 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1261  Cysteine desulfurase  35.94 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0457777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  38.84 
 
 		 387 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.27 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  39.18 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  37.87 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  37.87 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.57 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  36.19 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  37.73 
 
 		 402 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  37.63 
 
 		 398 aa  243  3e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1772  aminotransferase, class V  38.32 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1807  aminotransferase class V  38.32 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.113842  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  36.64 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  38.87 
 
 		 399 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  40.92 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.08 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  40.11 
 
 		 502 aa  239  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  40.6 
 
 		 379 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  38.71 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  40.85 
 
 		 417 aa  238  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4080  aminotransferase class V  37.43 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  38.92 
 
 		 493 aa  237  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0603  aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  35.62 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  38.68 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4043  aminotransferase class V  37.43 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  38.71 
 
 		 399 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.23 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  40.43 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  40.38 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0627  cysteine desulfurase  40.69 
 
 		 404 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>