131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1029 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1029  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00928266  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0908  orotate phosphoribosyltransferase  99.47 
 
 		 189 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0377  orotate phosphoribosyltransferase  55.67 
 
 		 189 aa  191  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  49.23 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  53.65 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0923  orotate phosphoribosyltransferase  50.26 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09430  orotate phosphoribosyltransferase  45.13 
 
 		 193 aa  187  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000503658  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1382  orotate phosphoribosyltransferase  50.52 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2760  orotate phosphoribosyltransferase  44.67 
 
 		 195 aa  186  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2126  orotate phosphoribosyltransferase  47.69 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2348  orotate phosphoribosyltransferase  47.92 
 
 		 191 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.841957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3874  orotate phosphoribosyltransferase  51.56 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1813  orotate phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 		 190 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000567028  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 		 196 aa  174  9e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1689  orotate phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 191 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1277  hypothetical protein  45.08 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  50.51 
 
 		 196 aa  167  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2430  orotate phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2163  orotate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 		 193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.560543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1574  orotate phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 		 194 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0783619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0588  orotate phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0256726  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0602  orotate phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0459  orotate phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 		 191 aa  158  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2048  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2571  orotate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.13902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2407  orotate phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.9504  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0032  orotate phosphoribosyltransferase  43.09 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2806  orotate phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 		 188 aa  152  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0017  orotate phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.722393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 		 194 aa  148  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3518  orotate phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 		 196 aa  147  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2281  orotate phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0269  orotate phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2869  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.943845  normal  0.0213162 
 
 
-
 
NC_002978  WD0228  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3194  orotate phosphoribosyltransferase  43.08 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20632  normal  0.456055 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1509  orotate phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3390  orotate phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0538  orotate phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0032  orotate phosphoribosyltransferase  43.52 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0034  orotate phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2572  orotate phosphoribosyltransferase  45 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1004  orotate phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0258  orotate phosphoribosyltransferase  40.2 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0231  orotate phosphoribosyltransferase  39.59 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2712  orotate phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 190 aa  141  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0211  orotate phosphoribosyltransferase  38.92 
 
 		 202 aa  140  9e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0704875  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1866  orotate phosphoribosyltransferase  40.39 
 
 		 202 aa  140  9e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0284  orotate phosphoribosyltransferase  39.7 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_976  orotate phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0469  orotate phosphoribosyltransferase  39.69 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0397818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1368  orotate phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0653  orotate phosphoribosyltransferase  42.27 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364226  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0646  orotate phosphoribosyltransferase  42.27 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.704446  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2109  orotate phosphoribosyltransferase  40.29 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00335386  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0886  orotate phosphoribosyltransferase  36.92 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.917527  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2635  orotate phosphoribosyltransferase  41.24 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0138  orotate phosphoribosyltransferase  43.82 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1108  orotate phosphoribosyltransferase  37.24 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.899932  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2339  orotate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375656  hitchhiker  0.00775418 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2068  orotate phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 		 202 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1780  orotate phosphoribosyltransferase  38.69 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1343  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000345754 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1087  orotate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3840  phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000401087 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  26.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  26.29 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  25.71 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 178 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  30.59 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  24.56 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  23.84 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  25.33 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6227  orotate phosphoribosyltransferase  27.48 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  26.21 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4354  orotate phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.405155  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  34.23 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1652  orotate phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>