More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0406 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0230  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 336 aa  672    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0406  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 359 aa  719    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0116053 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  38.38 
 
 		 370 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1097  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.372916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1197  glycosyl transferase group 1  22.31 
 
 		 367 aa  97.1  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.788986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.95 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  24.93 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  29.48 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1099  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.36 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  22.35 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  31.36 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.91 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 379 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  24.51 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  27.57 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  21.53 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.67 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.79 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  29.02 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.18 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.3 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  22.05 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4575  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.161634  normal  0.819576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.58 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  23.55 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  39.76 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2544  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.434322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  31.16 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  23.37 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  24.44 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 822 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1440  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.185476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  39.33 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1763  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.656807  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 748 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.8 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.86 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 904 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  22.79 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  23.23 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  23.23 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 828 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 430 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.23 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  26.67 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  38.64 
 
 		 431 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>