214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0118 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3287  putative hemolysin  55.1 
 
 		 260 aa  263  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4131  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  49.31 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  52.29 
 
 		 263 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  48.69 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  45.17 
 
 		 358 aa  238  8e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  49.4 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  49.6 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0655  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  54.15 
 
 		 251 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127166 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1448  hemolysin A  46.03 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.948802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  40.08 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  40.86 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  41.73 
 
 		 268 aa  175  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  42.74 
 
 		 271 aa  168  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  41.11 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  40.96 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  40.32 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  40.32 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  43.6 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  39.15 
 
 		 278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  42.06 
 
 		 252 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  37.7 
 
 		 243 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  39.76 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  41.94 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  41.47 
 
 		 272 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  41.83 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  41.25 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  40.32 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  42.15 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  42.17 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  40.16 
 
 		 246 aa  161  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  40.56 
 
 		 288 aa  161  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  40.71 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  39.29 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  39.53 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  35.87 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  39.52 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  39.52 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  39.52 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  39.22 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  39.52 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  39.22 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  39.52 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  38.74 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  38.04 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  40.16 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  39.22 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  37.05 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  38.74 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  40.16 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  41.18 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  39.53 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  39.22 
 
 		 250 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  39.53 
 
 		 266 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  39.11 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  41.27 
 
 		 258 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  39.44 
 
 		 268 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  39.11 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  43.85 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  40.15 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  41.04 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2834  hemolysin A  47.03 
 
 		 250 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182775  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  38.58 
 
 		 267 aa  155  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  37.94 
 
 		 279 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  40.4 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  41.67 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  38.46 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12600  predicted protein  43.48 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.78844 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  41.67 
 
 		 267 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  38.67 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  37.85 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  38.13 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2652  hemolysin A  41.6 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0532762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  38.1 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  40.23 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  37.65 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  38.76 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  40.24 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  39.77 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  38.58 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  40.32 
 
 		 251 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  41.04 
 
 		 276 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  39.44 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  39.76 
 
 		 270 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  40.94 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  41.41 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  44.71 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  38.11 
 
 		 255 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  43.52 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2169  hemolysin A  39.13 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00065154  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  39.68 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  38.74 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  40.96 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2767  hemolysin A  36.73 
 
 		 240 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000408099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  38.87 
 
 		 253 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  39.84 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  40.16 
 
 		 250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  35.46 
 
 		 248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1098  hemolysin A  42.23 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  36.72 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>