125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0854 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0854  L-ribulokinase (putative)  100 
 
 
539 aa  1108    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0480  carbohydrate kinase, FGGY  56.6 
 
 
540 aa  639    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.50905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1145  carbohydrate kinase FGGY  54.78 
 
 
532 aa  625  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0227  L-ribulokinase (putative)  54.3 
 
 
532 aa  608  9.999999999999999e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1020  putative L-ribulokinase  52.45 
 
 
548 aa  586  1e-166  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3468  carbohydrate kinase FGGY  51.99 
 
 
535 aa  587  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0242  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  50.19 
 
 
531 aa  559  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14138  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0034  sugar kinase  50.85 
 
 
530 aa  555  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2755  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  50.38 
 
 
538 aa  548  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.018415  decreased coverage  0.00000370584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0496  carbohydrate kinase FGGY  49.06 
 
 
539 aa  541  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.906538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0401  carbohydrate kinase FGGY  50.38 
 
 
537 aa  512  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29500  pentulose/hexulose kinase  46.12 
 
 
546 aa  497  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42527  predicted protein  28.78 
 
 
522 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000294856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  25.45 
 
 
500 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  21.82 
 
 
498 aa  75.5  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  20.45 
 
 
496 aa  73.9  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  23.58 
 
 
493 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  19.96 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  22.31 
 
 
505 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  24.74 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  22.81 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  20.69 
 
 
495 aa  64.7  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  24.2 
 
 
499 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  25 
 
 
496 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  22.65 
 
 
489 aa  61.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  23.75 
 
 
498 aa  60.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  23.14 
 
 
506 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  24.04 
 
 
494 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  24.21 
 
 
493 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.14 
 
 
490 aa  58.9  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  22.92 
 
 
485 aa  57.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  20.7 
 
 
497 aa  57.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  21.88 
 
 
493 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  21.83 
 
 
510 aa  57.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  21.94 
 
 
498 aa  57  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  21.33 
 
 
512 aa  57  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  26.67 
 
 
505 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  22.34 
 
 
493 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  22.84 
 
 
486 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  23.16 
 
 
487 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  22.34 
 
 
493 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  22.84 
 
 
486 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  22.84 
 
 
486 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  22.13 
 
 
502 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  21.63 
 
 
486 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  23.79 
 
 
486 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2464  carbohydrate kinase FGGY  22.18 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  23.47 
 
 
499 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  23.05 
 
 
475 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  23.05 
 
 
475 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  23.05 
 
 
475 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  23.05 
 
 
475 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  29.7 
 
 
494 aa  52.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  24 
 
 
482 aa  52  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  21.75 
 
 
493 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  20.9 
 
 
518 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  21.75 
 
 
493 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  20.49 
 
 
511 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  21.75 
 
 
493 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  21.35 
 
 
493 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  26.55 
 
 
504 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  24.12 
 
 
485 aa  51.2  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  21.72 
 
 
491 aa  50.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3164  xylulokinase  23.47 
 
 
526 aa  50.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189364  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  23.83 
 
 
485 aa  50.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  21.98 
 
 
484 aa  50.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  22.2 
 
 
515 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  20.92 
 
 
481 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  22.86 
 
 
483 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  22.86 
 
 
483 aa  48.9  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  21.25 
 
 
496 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  21.37 
 
 
496 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  27.19 
 
 
486 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  22.16 
 
 
463 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  20.14 
 
 
490 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  26.32 
 
 
492 aa  48.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  20.14 
 
 
490 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  20.35 
 
 
490 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  20.35 
 
 
490 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  21.56 
 
 
509 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  24.75 
 
 
483 aa  47.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  22.08 
 
 
502 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  22.11 
 
 
485 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  26.06 
 
 
546 aa  47  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  26.06 
 
 
546 aa  47  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3071  xylulokinase  21.43 
 
 
488 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  22.68 
 
 
492 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  22.68 
 
 
492 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  24 
 
 
485 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  23.2 
 
 
492 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  22.7 
 
 
491 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  21.11 
 
 
488 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  21.11 
 
 
488 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  26.17 
 
 
530 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  24.14 
 
 
484 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  21.71 
 
 
496 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  26.73 
 
 
484 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  26.73 
 
 
484 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  26.73 
 
 
484 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  20.92 
 
 
484 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>