More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4175 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  100 
 
 
391 aa  715    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  57.62 
 
 
371 aa  295  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  52.01 
 
 
367 aa  292  7e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  54.52 
 
 
372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  52.86 
 
 
358 aa  275  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  55.25 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  50.83 
 
 
347 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  50.55 
 
 
369 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  52.2 
 
 
361 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  53.22 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  53.22 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  53.22 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  54.49 
 
 
358 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  54.62 
 
 
359 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  48.7 
 
 
347 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  47.5 
 
 
402 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4507  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
367 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  50 
 
 
354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  48.47 
 
 
354 aa  226  7e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  44.24 
 
 
384 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.06 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  45.66 
 
 
352 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1233  ABC transporter related  50.42 
 
 
361 aa  212  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.642029  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
349 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2304  ABC transporter related protein  55.6 
 
 
335 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4968  ABC transporter related protein  49.72 
 
 
350 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  46.98 
 
 
385 aa  202  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  46.22 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1851  ABC transporter related  46.08 
 
 
219 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0521462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  43.4 
 
 
387 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 
387 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  41.57 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.31 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.68 
 
 
386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  37.83 
 
 
369 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.05 
 
 
384 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.59 
 
 
386 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.5 
 
 
379 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  37.5 
 
 
369 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  41.92 
 
 
368 aa  182  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  40.34 
 
 
360 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  31.75 
 
 
352 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1510  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.53 
 
 
390 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.6 
 
 
384 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.59 
 
 
386 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  37.79 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  37.79 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.82 
 
 
384 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.15 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  37.79 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.15 
 
 
384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.36 
 
 
377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
386 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
386 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.6 
 
 
379 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 
384 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.15 
 
 
381 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.15 
 
 
384 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.45 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  38.08 
 
 
349 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.15 
 
 
384 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  42.15 
 
 
384 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  42.45 
 
 
366 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
386 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1951  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  39.39 
 
 
388 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.118481  normal  0.624286 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.25 
 
 
386 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.25 
 
 
386 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.25 
 
 
386 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  37.18 
 
 
330 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2308  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.7 
 
 
388 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380588  normal  0.151342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  38.08 
 
 
368 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794001  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.92 
 
 
377 aa  177  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.92 
 
 
377 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.92 
 
 
377 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.48 
 
 
377 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.48 
 
 
400 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 
352 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  43.05 
 
 
331 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.05 
 
 
331 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.28 
 
 
387 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.84 
 
 
375 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.66 
 
 
366 aa  176  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  36 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  41.6 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  42.86 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  39.77 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  36.03 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.34 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.34 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.34 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 
331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>