281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3909 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3909  periplasmic binding protein  100 
 
 
341 aa  668    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07950  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  46.21 
 
 
349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0346758  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3735  periplasmic binding protein  39.14 
 
 
361 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22070  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  41.86 
 
 
383 aa  210  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.162415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3694  periplasmic binding protein  39.81 
 
 
341 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3935  periplasmic binding protein  35.51 
 
 
373 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.427342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3071  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  37.65 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17020  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.96 
 
 
346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.745589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2580  periplasmic binding protein  42.94 
 
 
354 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2930  periplasmic binding protein  36.95 
 
 
365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3522  periplasmic binding protein  40.59 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1491  putative ABC transporter, periplasmic iron-siderophore binding protein  36.2 
 
 
347 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00253008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2085  periplasmic binding protein  35.55 
 
 
354 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000968789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2819  periplasmic binding protein  35.71 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  36.1 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  38.33 
 
 
662 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06470  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  38.58 
 
 
353 aa  182  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.72 
 
 
358 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2441  ferric enterobactin ABC transporter, ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  34.62 
 
 
359 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3183  ferric enterobactin ABC transporter ferric enterobactin-binding periplasmic protein FepB  34.62 
 
 
359 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.197139 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3331  transport system permease protein  37.29 
 
 
324 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.411353  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2540  periplasmic binding protein  34.29 
 
 
359 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.501058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2175  periplasmic binding protein  38.55 
 
 
352 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.038626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0428  periplasmic binding protein  36.19 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0856962  normal  0.313337 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2827  periplasmic binding protein  35.76 
 
 
332 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3636  periplasmic binding protein  35.43 
 
 
325 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3416  ABC Fe+3-siderophore transporter, periplasmic binding protein  36.12 
 
 
325 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2670  periplasmic binding protein  40.47 
 
 
351 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3061  periplasmic binding protein  35.79 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  0.218558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36350  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.8 
 
 
356 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4296  periplasmic binding protein  35.51 
 
 
346 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0138  iron-siderophore ABC transporter, periplasmic binding protein  34.47 
 
 
316 aa  165  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19080  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.71 
 
 
347 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895091  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2317  periplasmic binding protein  37.83 
 
 
345 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26550  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.12 
 
 
348 aa  159  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0807  periplasmic binding protein  35.42 
 
 
343 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0385  periplasmic binding protein  34.58 
 
 
365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  34.15 
 
 
322 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5065  periplasmic binding protein  35.31 
 
 
336 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22710  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.14 
 
 
345 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3470  periplasmic binding protein  38.26 
 
 
356 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00150315  hitchhiker  0.00510017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0853  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.42 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.899813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4288  periplasmic binding protein  36.21 
 
 
359 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515343  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0418  twin-arginine translocation pathway signal  33.22 
 
 
347 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0419  periplasmic binding protein  31.65 
 
 
344 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.182541  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2437  periplasmic binding protein  34.17 
 
 
351 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.0637289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1591  periplasmic binding protein  33.44 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0300116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4230  periplasmic binding protein  31.93 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.973317  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2592  periplasmic binding protein  33.64 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366339  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2692  periplasmic binding protein  33.77 
 
 
349 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154596  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4037  periplasmic binding protein  31.62 
 
 
339 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0269  periplasmic binding protein  33.12 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448293  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0270  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0280  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0971022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0260  periplasmic binding protein  30.77 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0375  periplasmic binding protein  31.37 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0308  periplasmic binding protein  31.36 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5337  periplasmic binding protein  30.16 
 
 
338 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0708  periplasmic binding protein  29.33 
 
 
318 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.792334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.95 
 
 
322 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.64 
 
 
322 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  27.39 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.62 
 
 
321 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.62 
 
 
321 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.78 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.78 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  27.54 
 
 
321 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.54 
 
 
321 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2219  periplasmic binding protein  36.41 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0176424  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  28.09 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  29.19 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  27.07 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3759  periplasmic binding protein  29.29 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3501  periplasmic binding protein  36.51 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.897036  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  26.81 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10269  periplasmic iron-transport lipoprotein  28.03 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.110209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  28.21 
 
 
298 aa  80.1  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  28.47 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  32.37 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  30.46 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  30.46 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2749  periplasmic binding protein  28.22 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  27.51 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  24.92 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3787  periplasmic binding protein  36.18 
 
 
314 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  36.15 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4907  periplasmic binding protein  32.1 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  27.47 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4018  periplasmic binding protein  28.19 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293424  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  24.44 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  31.86 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1005  periplasmic binding protein  27.24 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1001  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, periplasmic vibriobactin/enterobactin-binding protein  26.97 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000270207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0632  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  28.96 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  30.92 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0021  periplasmic binding protein  27.69 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  25.91 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  28.41 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  28.96 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  24.91 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>