More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2306 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 262 aa  512  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  42.41 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  38.65 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  35.27 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1566  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.74 
 
 		 259 aa  98.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.24 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.65 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 275 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.84 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6278  Alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 282 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 280 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  30.31 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  30.38 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.17 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.79 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  30.95 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  28.87 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  25.77 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  32.07 
 
 		 397 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  28.1 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  28.1 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  28.1 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.8 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  28.1 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.44 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  28.51 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.98 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.89 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  28.8 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  28.1 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.63 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2183  alpha/beta hydrolase fold protein  34.96 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0185108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  27.34 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  27 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  32 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  27.85 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  27.6 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  32.58 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>