More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0984 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 335 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  45.26 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  40.92 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  36.92 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  39.45 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  38.41 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  41.02 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  40.39 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  37.27 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  41.99 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  39.88 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  35.62 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  40.37 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 		 320 aa  179  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  37.92 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  40.18 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  34.92 
 
 		 362 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  31.38 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  40.67 
 
 		 338 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  36.56 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  40.99 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  34.17 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  40.38 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  33.54 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  41.09 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  42.2 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  39.53 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  35.52 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  38.15 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  36.73 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  38.23 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.94 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 321 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.65 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  32.65 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  34.36 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  37.34 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  40.08 
 
 		 667 aa  149  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.91 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  38.46 
 
 		 354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  31.29 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  35.91 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  29.52 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  38.82 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.92 
 
 		 670 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  30.04 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  29.96 
 
 		 326 aa  137  4e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  34.85 
 
 		 667 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  32.15 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.74 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  34.34 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  45.16 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.92 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.46 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  38.28 
 
 		 665 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  27.13 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  29.76 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  29.68 
 
 		 381 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  30.8 
 
 		 374 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  31.81 
 
 		 667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  34.98 
 
 		 667 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  30.17 
 
 		 381 aa  119  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  27.63 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  34.27 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  26.94 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  27.27 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  32.73 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  31.87 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  32.01 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  28.38 
 
 		 342 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  25.45 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  32.22 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  31.99 
 
 		 451 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6081  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  26.96 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  32.83 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  38.21 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04820  conserved hypothetical protein  29.12 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  38.46 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  31.4 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.52 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.52 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.52 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  32.52 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  32.52 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  28.66 
 
 		 331 aa  99.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.91 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.91 
 
 		 331 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>