47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1748 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  100 
 
 		 1011 aa  2063    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5581  hypothetical protein  70.76 
 
 		 358 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5984  hypothetical protein  70.76 
 
 		 358 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0555874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  28.82 
 
 		 1028 aa  308  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  28.4 
 
 		 1028 aa  301  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5585  hypothetical protein  79.63 
 
 		 258 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0168828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  89.34 
 
 		 145 aa  229  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  89.34 
 
 		 145 aa  229  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  27.89 
 
 		 995 aa  205  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  27.32 
 
 		 992 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  25.2 
 
 		 937 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  24.78 
 
 		 916 aa  161  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5989  ATPase involved in DNA repair  72.84 
 
 		 105 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000456113 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5588  ATPase involved in DNA repair  72.84 
 
 		 105 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  27.33 
 
 		 990 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  42.25 
 
 		 428 aa  107  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  23.08 
 
 		 966 aa  107  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1243  hypothetical protein  23.6 
 
 		 743 aa  105  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  34.52 
 
 		 877 aa  103  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  33.95 
 
 		 889 aa  97.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  38.21 
 
 		 853 aa  97.8  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  36.43 
 
 		 888 aa  94.7  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  46.28 
 
 		 894 aa  93.6  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  41.8 
 
 		 906 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  34.78 
 
 		 883 aa  88.2  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  33.57 
 
 		 897 aa  88.2  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  37.7 
 
 		 909 aa  84.7  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  26.38 
 
 		 938 aa  81.6  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  32.72 
 
 		 892 aa  80.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  38.1 
 
 		 884 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  35.16 
 
 		 895 aa  77  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  30 
 
 		 972 aa  76.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  38.66 
 
 		 633 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 894 aa  74.3  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  38.66 
 
 		 633 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  38.66 
 
 		 633 aa  73.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  33.33 
 
 		 894 aa  74.3  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  32.64 
 
 		 955 aa  72  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  36.43 
 
 		 896 aa  72  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  33.96 
 
 		 929 aa  70.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  33.1 
 
 		 943 aa  69.3  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  35.97 
 
 		 931 aa  69.3  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  31.97 
 
 		 617 aa  68.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  31.72 
 
 		 902 aa  50.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0235  hypothetical protein  27.74 
 
 		 713 aa  47.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  27.14 
 
 		 709 aa  46.6  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  31.39 
 
 		 891 aa  46.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>