228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1498 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 296 aa  595  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  52.2 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  52.19 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  48.58 
 
 		 310 aa  258  7e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  50.54 
 
 		 278 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  48.23 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  49.82 
 
 		 273 aa  241  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  51.96 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  50.35 
 
 		 279 aa  238  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  51.26 
 
 		 268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  48.26 
 
 		 287 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  46.43 
 
 		 269 aa  225  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  48.89 
 
 		 286 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  45.88 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  42.71 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  45.33 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  44.29 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  42.91 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  44.19 
 
 		 306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  45.14 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  45.14 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  47.21 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  43.01 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  40.97 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  33.46 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  33.08 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  36.73 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  33.74 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  59.52 
 
 		 395 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  32.5 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  32.52 
 
 		 274 aa  145  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  34.31 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  55.56 
 
 		 380 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  36.41 
 
 		 261 aa  135  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  28.79 
 
 		 256 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  55.28 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  48.3 
 
 		 384 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  50.38 
 
 		 393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  35.95 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  30.61 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  44.38 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  31.43 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  34.13 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  42.62 
 
 		 371 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.21 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  28.4 
 
 		 255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.3 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  34.3 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  34.3 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  34.3 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  48.44 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  34.3 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.3 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  44.03 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  41.67 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  38.21 
 
 		 373 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  33.72 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  39.02 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  33.14 
 
 		 373 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  31.33 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  31.87 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  45.93 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  32.82 
 
 		 238 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  28.1 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  41.09 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  30.73 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  37.88 
 
 		 373 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  45.16 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  39.06 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  31.19 
 
 		 264 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  40.94 
 
 		 370 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  50.39 
 
 		 379 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  50.39 
 
 		 379 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  50.39 
 
 		 379 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  44.95 
 
 		 375 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  43.24 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  42.34 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  43.75 
 
 		 379 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  31.31 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  35.43 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  34.85 
 
 		 373 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  41.1 
 
 		 373 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  34.71 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  31.75 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1515  hypothetical protein  34.62 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  29.13 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  28.81 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  47.69 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  24.41 
 
 		 274 aa  93.6  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  37.5 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  28.98 
 
 		 254 aa  93.2  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  40.83 
 
 		 372 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  27.54 
 
 		 262 aa  92.4  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  30 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  40.95 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  32.56 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  26.89 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  36.08 
 
 		 372 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1271  hypothetical protein  34.65 
 
 		 235 aa  89.7  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  27.37 
 
 		 240 aa  89.7  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>