More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5187 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013747  Htur_5187  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 116 aa  231  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3383  Thioredoxin domain protein  56.86 
 
 		 123 aa  129  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.346342  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0459  Thioredoxin domain protein  53.33 
 
 		 118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0621095  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2342  Thioredoxin domain protein  57.83 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.81204  normal  0.184046 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3714  Thioredoxin domain protein  45.63 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4290  Thioredoxin domain protein  46.53 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0359  Thioredoxin domain protein  47 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0762376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3640  thioredoxin  35.58 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  33.98 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4319  thioredoxin  34.88 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.930144  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  36.84 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  32.99 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  37.11 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  33.33 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2236  thioredoxin  36.96 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.773662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  35.48 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  38 
 
 		 289 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  35.79 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  36.96 
 
 		 290 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  36.59 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  35.64 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  37.62 
 
 		 290 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  37.23 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  36.96 
 
 		 290 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  35.87 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  35.87 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  36.96 
 
 		 290 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  33.04 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0032  Thioredoxin domain protein  33.73 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0030  thioredoxin domain protein  33.73 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  37.11 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  34.09 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  33.63 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  33.33 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  34.95 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  34.44 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  35.96 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  28.57 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  28.28 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  28.28 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1984  glutaredoxin 2  31.03 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  33.78 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0053  thioredoxin  32.98 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000803765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3396  putative thioredoxin  31.52 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  24.76 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  33.33 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.95 
 
 		 290 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1123  thioredoxin  34.78 
 
 		 145 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3437  thioredoxin  30.93 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3070  thioredoxin  38.46 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.990711  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1320  thioredoxin  36.26 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.113501  normal  0.148362 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  35.56 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1582  thioredoxin  35.64 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137556  normal  0.0376163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  30.49 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  40.91 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  34.67 
 
 		 290 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  33.73 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1129  thioredoxin  35.37 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1160  thioredoxin  35.37 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0193016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2158  thioredoxin  33.01 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0651  thioredoxin  33.67 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3675  thioredoxin  28.16 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.852228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  32.5 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03717  thioredoxin  28.44 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  32.53 
 
 		 109 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  31.4 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  38.89 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18120  thioredoxin  23.3 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1332  thioredoxin  31.96 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4260  thioredoxin  33.73 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0524  Thioredoxin domain protein  28.42 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  33.78 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  35.48 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  30 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  30.49 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  30 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  30 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  31.71 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  37.7 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  29.59 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  37.7 
 
 		 108 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  27.17 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  36.07 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  30 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  36.47 
 
 		 268 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  33.33 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  37.88 
 
 		 406 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  33.73 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  33.73 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  31.71 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  34.85 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  33.73 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>