More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5137 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5137  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 
433 aa  836    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0099  sodium:dicarboxylate symporter  65.73 
 
 
430 aa  561  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  62.03 
 
 
445 aa  525  1e-148  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  53.33 
 
 
439 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3995  sodium:dicarboxylate symporter  53.5 
 
 
434 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.845603  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0216  sodium:dicarboxylate symporter  53.73 
 
 
421 aa  433  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.013646 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  41.05 
 
 
430 aa  312  9e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1241  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  40.14 
 
 
432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  41.38 
 
 
444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  41.61 
 
 
444 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  41.61 
 
 
444 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  42.86 
 
 
430 aa  307  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  41.38 
 
 
444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  40.65 
 
 
433 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  40.66 
 
 
432 aa  300  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  41.25 
 
 
443 aa  299  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  40.77 
 
 
440 aa  297  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  40.77 
 
 
435 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  40.77 
 
 
440 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  41.26 
 
 
449 aa  292  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  41.48 
 
 
424 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  41.29 
 
 
428 aa  288  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  39.6 
 
 
409 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  40.5 
 
 
409 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  41.42 
 
 
417 aa  259  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  40.11 
 
 
410 aa  256  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2336  sodium/dicarboxylate symporter family protein  36.73 
 
 
423 aa  256  5e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000234302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0795  sodium:dicarboxylate symporter  40.59 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  39.95 
 
 
402 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  40.92 
 
 
439 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  42.55 
 
 
436 aa  250  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  40.21 
 
 
449 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  39.9 
 
 
436 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  41.11 
 
 
447 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  40.05 
 
 
434 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  42.28 
 
 
436 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  39.65 
 
 
437 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  38.17 
 
 
437 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  39.65 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  41.08 
 
 
442 aa  243  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.6 
 
 
437 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  40.92 
 
 
440 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  38.68 
 
 
437 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  38.71 
 
 
445 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  40.92 
 
 
440 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  39.95 
 
 
434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  40.92 
 
 
440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  40.92 
 
 
440 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  35.78 
 
 
457 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  38.85 
 
 
411 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  38.35 
 
 
411 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  40.49 
 
 
441 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  39.41 
 
 
434 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  36.71 
 
 
424 aa  236  7e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  35.31 
 
 
457 aa  235  9e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  38.35 
 
 
411 aa  235  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.1 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  38.1 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  38.1 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  38.1 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  38.1 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  38.1 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  38.03 
 
 
433 aa  233  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  38.85 
 
 
411 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  39.79 
 
 
448 aa  233  7.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2790  sodium:dicarboxylate symporter  36.91 
 
 
425 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255988  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  34.62 
 
 
440 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  34.72 
 
 
427 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  37.47 
 
 
411 aa  230  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  35.94 
 
 
413 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  34.29 
 
 
416 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  39.39 
 
 
436 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  41.85 
 
 
438 aa  227  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  40.51 
 
 
437 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  36.75 
 
 
424 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  35.22 
 
 
425 aa  223  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  36.75 
 
 
424 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  37.87 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2861  Sodium/dicarboxylate symporter  36.48 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  37.63 
 
 
457 aa  219  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  36.07 
 
 
437 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  34.31 
 
 
441 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  34.23 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  32.94 
 
 
417 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  35.83 
 
 
437 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  33.97 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  33.64 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  33.56 
 
 
419 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  33.56 
 
 
419 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  33.64 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  33.64 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  33.97 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  33.97 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  33.97 
 
 
416 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  33.73 
 
 
445 aa  210  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  35.99 
 
 
409 aa  209  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  33.9 
 
 
419 aa  207  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0633  Sodium:dicarboxylate symporter  34.88 
 
 
422 aa  206  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  35.79 
 
 
419 aa  206  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  34.93 
 
 
425 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>