More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3639 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  83.09 
 
 		 604 aa  1007    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2725  excinuclease ABC subunit C  70.3 
 
 		 592 aa  808    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  100 
 
 		 597 aa  1195    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  67.05 
 
 		 579 aa  783    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1072  excinuclease ABC subunit C  70.85 
 
 		 575 aa  768    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353425  normal  0.0879577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  35.84 
 
 		 607 aa  352  8.999999999999999e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 		 613 aa  343  4e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  37.74 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  35.03 
 
 		 641 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 		 557 aa  335  9e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  36.6 
 
 		 622 aa  335  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  36.06 
 
 		 624 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  33.97 
 
 		 607 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 607 aa  329  7e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  31.65 
 
 		 615 aa  329  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  36.95 
 
 		 607 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  36.17 
 
 		 610 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1124  excinuclease ABC subunit C  36.8 
 
 		 616 aa  323  5e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.957907  decreased coverage  0.0034731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  37.18 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  34.31 
 
 		 601 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 631 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  34.02 
 
 		 607 aa  320  3e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  32.79 
 
 		 598 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0701  excinuclease ABC subunit C  36.47 
 
 		 598 aa  319  7e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  35.79 
 
 		 691 aa  319  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  34.89 
 
 		 653 aa  319  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  34.83 
 
 		 616 aa  318  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  36.19 
 
 		 623 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  34.81 
 
 		 624 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  36.19 
 
 		 623 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  32.16 
 
 		 685 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  35.76 
 
 		 644 aa  317  6e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  34.82 
 
 		 588 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2397  excinuclease ABC subunit C  33.5 
 
 		 598 aa  316  8e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.866418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1060  excinuclease ABC subunit C  36.42 
 
 		 658 aa  316  9e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41739  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  36.7 
 
 		 690 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  33.07 
 
 		 628 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  30.61 
 
 		 620 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  30.76 
 
 		 620 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  35.86 
 
 		 623 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  33.7 
 
 		 619 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  36.17 
 
 		 607 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0772  excinuclease ABC subunit C  36.04 
 
 		 633 aa  313  6.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00962744  normal  0.347624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  36.17 
 
 		 607 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  35.65 
 
 		 653 aa  312  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  35.85 
 
 		 607 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 		 605 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  34.79 
 
 		 635 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  35.98 
 
 		 607 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  34.32 
 
 		 520 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  36.31 
 
 		 639 aa  310  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  33.93 
 
 		 612 aa  310  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  33.97 
 
 		 591 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  34.52 
 
 		 610 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  34.52 
 
 		 610 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  34.52 
 
 		 610 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  34.52 
 
 		 610 aa  309  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  37 
 
 		 644 aa  309  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 627 aa  309  9e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  34.52 
 
 		 610 aa  309  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 618 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  35.03 
 
 		 680 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  36.13 
 
 		 631 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  34.52 
 
 		 610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 634 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  35.75 
 
 		 690 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  32.58 
 
 		 618 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3671  excinuclease ABC subunit C  35.88 
 
 		 585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159711  hitchhiker  0.0000000375345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  32.45 
 
 		 638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2140  excinuclease ABC subunit C  32.64 
 
 		 608 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  32.18 
 
 		 625 aa  307  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  34.35 
 
 		 610 aa  307  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  35.75 
 
 		 690 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  35.77 
 
 		 611 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  35.13 
 
 		 682 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  34.25 
 
 		 700 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  34.78 
 
 		 627 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  34.47 
 
 		 599 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  35.69 
 
 		 607 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  34.57 
 
 		 680 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  34.52 
 
 		 688 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  35.08 
 
 		 682 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1509  excinuclease ABC, C subunit  34.27 
 
 		 594 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.94656  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 628 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  33.28 
 
 		 619 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  30.9 
 
 		 603 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  34.96 
 
 		 599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  36.33 
 
 		 608 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  31.24 
 
 		 609 aa  304  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0782  excinuclease ABC subunit C  35.74 
 
 		 674 aa  303  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191761  normal  0.0714693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2053  excinuclease ABC subunit C  33.76 
 
 		 617 aa  303  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000011478  hitchhiker  0.000473429 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  32.9 
 
 		 613 aa  303  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2355  excinuclease ABC subunit C  33.76 
 
 		 617 aa  303  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0361706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  33.76 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2109  excinuclease ABC subunit C  34.68 
 
 		 610 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0217985  hitchhiker  0.00000000000000291711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  35.85 
 
 		 617 aa  302  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>