More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2927 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  100 
 
 
397 aa  803    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  69.92 
 
 
441 aa  559  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  59.4 
 
 
415 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0942  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.83 
 
 
408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2884  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.86 
 
 
372 aa  311  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  37.03 
 
 
405 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  38.11 
 
 
401 aa  231  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  37.03 
 
 
402 aa  229  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  38.11 
 
 
401 aa  226  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2793  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.09 
 
 
391 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150891  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  33.42 
 
 
404 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  33.16 
 
 
404 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  33.95 
 
 
404 aa  223  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  36.76 
 
 
399 aa  222  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  33.6 
 
 
404 aa  222  9e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  34.63 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  32.89 
 
 
403 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  36.27 
 
 
405 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  34.32 
 
 
416 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  35.95 
 
 
401 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  33.51 
 
 
421 aa  208  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  35.75 
 
 
403 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  35.37 
 
 
414 aa  206  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  34.37 
 
 
419 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  33.51 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  38.1 
 
 
419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  37.57 
 
 
422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  33.33 
 
 
454 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  35.13 
 
 
412 aa  196  8.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  34.63 
 
 
396 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  37.31 
 
 
404 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  34.44 
 
 
408 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  32.82 
 
 
434 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  33.67 
 
 
430 aa  193  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  35.86 
 
 
428 aa  192  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  33.16 
 
 
404 aa  192  9e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  35.6 
 
 
423 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  36.41 
 
 
418 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  35.49 
 
 
408 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  34.19 
 
 
429 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  32.91 
 
 
437 aa  187  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  34.28 
 
 
408 aa  187  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  31.79 
 
 
422 aa  186  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  35.32 
 
 
416 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  32.56 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  38.1 
 
 
459 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  35.26 
 
 
427 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  36.02 
 
 
411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  34.2 
 
 
416 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  34.39 
 
 
413 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  36.39 
 
 
425 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  35.32 
 
 
425 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  34.73 
 
 
424 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  36.57 
 
 
428 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  34.29 
 
 
432 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  32.82 
 
 
432 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  34.82 
 
 
413 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  32.82 
 
 
432 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  35.73 
 
 
439 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  35.68 
 
 
418 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  34.47 
 
 
419 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  35.42 
 
 
429 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  36.1 
 
 
424 aa  176  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  32.06 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  34.82 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  33.81 
 
 
433 aa  173  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  36.83 
 
 
428 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  33.07 
 
 
396 aa  169  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  36.02 
 
 
420 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  35.17 
 
 
403 aa  169  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  35.48 
 
 
426 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  34.55 
 
 
406 aa  166  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  30.45 
 
 
391 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  30.79 
 
 
394 aa  162  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.59 
 
 
311 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  32.28 
 
 
402 aa  159  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  35.71 
 
 
331 aa  153  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  32.73 
 
 
349 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  33.33 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  30.35 
 
 
371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.94 
 
 
371 aa  145  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.88 
 
 
356 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  31.83 
 
 
354 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  33.04 
 
 
363 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.89 
 
 
427 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  33.13 
 
 
346 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  30.79 
 
 
368 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  30.95 
 
 
420 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  27.55 
 
 
402 aa  143  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.29 
 
 
381 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2963  threonine synthase  29.38 
 
 
483 aa  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.01 
 
 
382 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  36.39 
 
 
366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  33.74 
 
 
362 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  34.25 
 
 
346 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  32.35 
 
 
377 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  32.35 
 
 
377 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  35.17 
 
 
360 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  36.04 
 
 
347 aa  138  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.37 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>