253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2963 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2963  threonine synthase  100 
 
 		 483 aa  1002    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  47.31 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0833  threonine synthase  46.28 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000348992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  41.73 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  42.23 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  39.86 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  39.66 
 
 		 405 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  42.48 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  41.5 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  40.05 
 
 		 404 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  39.66 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  40.05 
 
 		 399 aa  279  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  39.36 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  39.36 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  40.53 
 
 		 401 aa  270  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  38.46 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  38.79 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  38.26 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  39.66 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  37.83 
 
 		 459 aa  234  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  35.71 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37018  predicted protein  34.07 
 
 		 497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00212861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  38.97 
 
 		 351 aa  223  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  39.56 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  40.16 
 
 		 363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  34.47 
 
 		 394 aa  218  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  38.16 
 
 		 371 aa  217  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  38.72 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2321  threonine synthase  39.11 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  38.29 
 
 		 351 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  37.25 
 
 		 368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  34.13 
 
 		 367 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  39.12 
 
 		 368 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  36.57 
 
 		 354 aa  213  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  35.75 
 
 		 362 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  36.21 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  36.49 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  38.5 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  38.55 
 
 		 348 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  37.82 
 
 		 349 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2078  threonine synthase  34.6 
 
 		 452 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818493  normal  0.0807622 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  36.75 
 
 		 348 aa  208  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  41.33 
 
 		 356 aa  206  7e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2124  threonine synthase  34.72 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  36.47 
 
 		 348 aa  206  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  38.7 
 
 		 363 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  37.11 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  40.11 
 
 		 339 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  34.13 
 
 		 367 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  38.48 
 
 		 377 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  37.85 
 
 		 357 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  36.83 
 
 		 353 aa  204  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  36.83 
 
 		 353 aa  204  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  37.74 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  37.74 
 
 		 377 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  38.46 
 
 		 345 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  36.75 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2214  threonine synthase  34.53 
 
 		 452 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  37.92 
 
 		 351 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30231  threonine synthase  37.82 
 
 		 352 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  36.44 
 
 		 354 aa  199  7e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  36.05 
 
 		 396 aa  199  9e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  36.54 
 
 		 406 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  38.46 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  36.86 
 
 		 346 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  35.85 
 
 		 352 aa  195  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  30.83 
 
 		 421 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1836  threonine synthase  33.58 
 
 		 441 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  35.11 
 
 		 351 aa  193  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  35.99 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  38.14 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1723  L-threonine synthase  34.72 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0474  threonine synthase  38.66 
 
 		 376 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0634  threonine synthase  38.66 
 
 		 376 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  34.47 
 
 		 348 aa  187  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0435  threonine synthase  35.01 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  38.73 
 
 		 370 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  37.11 
 
 		 352 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  36.97 
 
 		 352 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  34.69 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  36.8 
 
 		 352 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  38.11 
 
 		 359 aa  183  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  34.57 
 
 		 348 aa  183  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  36.83 
 
 		 363 aa  183  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  34.19 
 
 		 348 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  37.04 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2453  threonine synthase  34.18 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1440  threonine synthase  35.03 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124795  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  37.18 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  37.18 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  37.18 
 
 		 360 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  36.8 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19330  L-threonine synthase  35.1 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  36.26 
 
 		 356 aa  180  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  38.4 
 
 		 360 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  34.48 
 
 		 357 aa  180  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  37.54 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  36.26 
 
 		 352 aa  179  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  37.46 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  37.09 
 
 		 347 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>