More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0833 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0833  threonine synthase  100 
 
 
445 aa  927    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000348992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2963  threonine synthase  46.28 
 
 
483 aa  355  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  40.5 
 
 
432 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  39.12 
 
 
408 aa  281  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  36.69 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  37.65 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  36.27 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  36.27 
 
 
404 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  37.02 
 
 
404 aa  231  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  36.52 
 
 
404 aa  230  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  36.27 
 
 
403 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  36.36 
 
 
401 aa  228  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  36.3 
 
 
401 aa  226  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  34.87 
 
 
405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  36.47 
 
 
423 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  34.86 
 
 
401 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  34.99 
 
 
419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  35.29 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  34.52 
 
 
422 aa  211  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  34.37 
 
 
391 aa  206  9e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  35.31 
 
 
459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  40.12 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  40.12 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  35.48 
 
 
396 aa  187  5e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  39.6 
 
 
366 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  41.12 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  37.81 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  40.19 
 
 
354 aa  184  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  37.06 
 
 
368 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  37.81 
 
 
349 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  37.27 
 
 
354 aa  182  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  39.54 
 
 
356 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  37.95 
 
 
368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  38.28 
 
 
368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  36.75 
 
 
351 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  39.62 
 
 
345 aa  178  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  40 
 
 
331 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  40.58 
 
 
352 aa  177  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  41.58 
 
 
352 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  41.58 
 
 
352 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  37.62 
 
 
351 aa  176  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  40.13 
 
 
366 aa  176  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  38.14 
 
 
351 aa  176  9e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  41.58 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  41.58 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  41.58 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  35.71 
 
 
403 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  41.58 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  37.46 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  38.54 
 
 
348 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  41.58 
 
 
352 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  36.42 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  41.25 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  38.54 
 
 
348 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  41.58 
 
 
352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  36.83 
 
 
354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  37.85 
 
 
346 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  37.14 
 
 
367 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  30.68 
 
 
394 aa  172  7.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  37.29 
 
 
368 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  39.93 
 
 
353 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  41.25 
 
 
352 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  35.22 
 
 
371 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  39.34 
 
 
360 aa  170  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  34.6 
 
 
406 aa  170  5e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  36.51 
 
 
363 aa  170  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  35.85 
 
 
351 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  39.67 
 
 
347 aa  168  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  37.24 
 
 
356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  39.07 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  35.53 
 
 
362 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  37.11 
 
 
356 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  37.14 
 
 
367 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  37.62 
 
 
360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  37.62 
 
 
360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  37.62 
 
 
360 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  38.17 
 
 
353 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  36.96 
 
 
357 aa  166  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  31.96 
 
 
419 aa  166  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2321  threonine synthase  36.63 
 
 
369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  29.89 
 
 
414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  34.41 
 
 
377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  36.63 
 
 
363 aa  165  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1836  threonine synthase  30.16 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  38.03 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2078  threonine synthase  30.55 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818493  normal  0.0807622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  36.58 
 
 
377 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  38.36 
 
 
370 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  36.58 
 
 
377 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  38.74 
 
 
359 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  36.22 
 
 
367 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  36.89 
 
 
355 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  36.34 
 
 
351 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  36.19 
 
 
352 aa  162  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  36.31 
 
 
360 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09880  L-threonine synthase  34.71 
 
 
355 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.704092  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  37.62 
 
 
352 aa  161  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0435  threonine synthase  31.48 
 
 
451 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1789  threonine synthase  37.35 
 
 
356 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  37.09 
 
 
348 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>