231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2716 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 427 aa  872    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  31.23 
 
 		 454 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  28.98 
 
 		 403 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  28.72 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  31.33 
 
 		 434 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  28.39 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  30.99 
 
 		 430 aa  142  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  28.46 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  31.07 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  28.35 
 
 		 404 aa  139  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  30.33 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  30.77 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  30.18 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.07 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  31.03 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  25.86 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  28.27 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  30.63 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  29.07 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  30.91 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  30.91 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  29.5 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  29.29 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  27.72 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  30.77 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  31.39 
 
 		 545 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  27.58 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  28.54 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  28.5 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  28 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  30.27 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  30.22 
 
 		 411 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  27.93 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3541  L-threonine synthase  26.75 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0314915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  26.98 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  27.89 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  26.15 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  30.13 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  27.98 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  31.63 
 
 		 356 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  31.3 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  27.52 
 
 		 418 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1454  L-threonine synthase  27.17 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.199227  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  28.61 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  28.54 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  27.49 
 
 		 352 aa  106  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  29.62 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  27.62 
 
 		 348 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  29.95 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  29.33 
 
 		 352 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  26.63 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  29.87 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  28.34 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  29.03 
 
 		 352 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  28.31 
 
 		 348 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  27.22 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  27.62 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  28.74 
 
 		 352 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  28.74 
 
 		 352 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  29.03 
 
 		 352 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  28.74 
 
 		 352 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  28.31 
 
 		 348 aa  103  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0503  L-threonine synthase  28.8 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  28.74 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  28.74 
 
 		 352 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  27.99 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  30.31 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  29.92 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  28.45 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  28.74 
 
 		 352 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  27.25 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  28.99 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  27.27 
 
 		 419 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2977  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.32 
 
 		 422 aa  99.8  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  28.31 
 
 		 346 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  29.1 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  28.36 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3650  threonine synthase  29.45 
 
 		 349 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  27.71 
 
 		 346 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  26.65 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  28.16 
 
 		 362 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09880  L-threonine synthase  29.82 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.704092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  28.05 
 
 		 352 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  28.14 
 
 		 352 aa  97.8  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  29.16 
 
 		 416 aa  97.1  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2734  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.82 
 
 		 425 aa  97.1  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  28.83 
 
 		 349 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  28.13 
 
 		 349 aa  96.3  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  29.48 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  23.24 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  29.91 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  27.36 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0111  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.25 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.726642  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  25.84 
 
 		 391 aa  95.5  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  27.96 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29950  threonine synthase  29 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  29.53 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  28.57 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  27.66 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0680  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.77 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>