146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2977 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2977  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  100 
 
 
422 aa  865    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717482  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0111  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  57.55 
 
 
430 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.726642  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0503  L-threonine synthase  54.96 
 
 
412 aa  427  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3541  L-threonine synthase  50.48 
 
 
416 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0314915  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2734  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.82 
 
 
425 aa  402  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2116  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  51.31 
 
 
424 aa  391  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1454  L-threonine synthase  45.99 
 
 
417 aa  345  7e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.199227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0680  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.14 
 
 
431 aa  315  7e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  25.51 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  26.67 
 
 
404 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  24.41 
 
 
404 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.32 
 
 
427 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  23.61 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  24.18 
 
 
404 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  25.42 
 
 
402 aa  96.7  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  24.23 
 
 
403 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  25.32 
 
 
405 aa  93.6  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  23.7 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  28.84 
 
 
545 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  24.94 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  23.78 
 
 
401 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  26.08 
 
 
403 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  26.2 
 
 
403 aa  86.3  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  26.07 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  22.74 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  24.25 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  23.68 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  23.45 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  23.45 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  25.12 
 
 
454 aa  73.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  24.41 
 
 
430 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  25.32 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  23.58 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  25.76 
 
 
405 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  24.62 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  24.62 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  25.5 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  24.46 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  24.46 
 
 
432 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  23.17 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  23.02 
 
 
346 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  22.77 
 
 
354 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  26.39 
 
 
345 aa  63.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  23.19 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  24.5 
 
 
352 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  22.67 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  22.88 
 
 
441 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  24.05 
 
 
422 aa  60.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  25.32 
 
 
346 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  23.39 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  21.74 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  22.28 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  23.68 
 
 
352 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  24.79 
 
 
437 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  22.36 
 
 
422 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  22.51 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  21.41 
 
 
351 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  22.53 
 
 
351 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  23.92 
 
 
361 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  24.12 
 
 
351 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  22.81 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  23.71 
 
 
402 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  21.55 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  27.91 
 
 
433 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0596  threonine synthase  22.39 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  22.42 
 
 
432 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1745  L-threonine synthase  23.48 
 
 
365 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0188218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  24.21 
 
 
352 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  21.81 
 
 
356 aa  53.5  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  22.69 
 
 
357 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  23.68 
 
 
346 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  24.25 
 
 
374 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  23.1 
 
 
351 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  24.38 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  25 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2963  threonine synthase  21.69 
 
 
483 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  22.39 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  23.39 
 
 
354 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  24.57 
 
 
377 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1836  threonine synthase  24.85 
 
 
441 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  22.19 
 
 
368 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  24.39 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  24.02 
 
 
352 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2321  threonine synthase  22.07 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  22.08 
 
 
368 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25 
 
 
356 aa  51.2  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  22.47 
 
 
414 aa  50.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  21.8 
 
 
368 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  23.84 
 
 
349 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  24.02 
 
 
352 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  24.02 
 
 
352 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  24.02 
 
 
352 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  24.02 
 
 
352 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  22.7 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  22.88 
 
 
459 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  23.37 
 
 
331 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  22.47 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  23.72 
 
 
352 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  22.86 
 
 
351 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  24.55 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>