159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1454 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1454  L-threonine synthase  100 
 
 
417 aa  866    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.199227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0680  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  53.12 
 
 
431 aa  425  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3541  L-threonine synthase  51.31 
 
 
416 aa  408  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0314915  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2977  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.99 
 
 
422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717482  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0111  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  46.76 
 
 
430 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.726642  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0503  L-threonine synthase  47.39 
 
 
412 aa  348  1e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2734  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.47 
 
 
425 aa  345  8e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2116  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.8 
 
 
424 aa  300  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.17 
 
 
427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  25.8 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  25.71 
 
 
403 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  24.94 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  26.1 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  25.42 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  25.51 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  25.14 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  25.15 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  25.59 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  25.56 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  24.42 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  24.1 
 
 
545 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  24.56 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  24.42 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  22.68 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  23.23 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  24.36 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  26.24 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  23.65 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  24.75 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  25.13 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  22.84 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  26.25 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  24.31 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  24.29 
 
 
422 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  25.88 
 
 
416 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  25.7 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  23.45 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  25.79 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  23.39 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  23.76 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  23.41 
 
 
356 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  25.7 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  23.22 
 
 
360 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  23.22 
 
 
360 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  23.22 
 
 
360 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  20.88 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  28.16 
 
 
433 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  23.62 
 
 
434 aa  63.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  23.76 
 
 
359 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  22.42 
 
 
423 aa  63.2  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  23.69 
 
 
346 aa  63.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  23.37 
 
 
351 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  24.78 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  24.11 
 
 
360 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  24.73 
 
 
349 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  25.5 
 
 
437 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1836  threonine synthase  23.43 
 
 
441 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  22.35 
 
 
427 aa  59.7  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  25.07 
 
 
414 aa  59.7  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  24.85 
 
 
351 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3650  threonine synthase  25.07 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  22.52 
 
 
348 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  26.46 
 
 
408 aa  59.7  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2453  threonine synthase  21.92 
 
 
360 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351882  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  21.71 
 
 
419 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  23.04 
 
 
405 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  23.05 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  23.05 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  22.43 
 
 
352 aa  58.9  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  22.78 
 
 
441 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  24.28 
 
 
352 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  24.82 
 
 
366 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  23.4 
 
 
361 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  22.97 
 
 
351 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  22.74 
 
 
354 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  22.59 
 
 
459 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  24.7 
 
 
331 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  24.63 
 
 
363 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  22.87 
 
 
374 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  21.68 
 
 
368 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  22.95 
 
 
370 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  23.27 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  21.59 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  21.02 
 
 
353 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  21.02 
 
 
353 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  20.54 
 
 
354 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  24.21 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  22.28 
 
 
348 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  22.76 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  24.34 
 
 
396 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2464  threonine synthase  23.34 
 
 
356 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08030  threonine synthase  24.65 
 
 
370 aa  54.3  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2355  threonine synthase  24.51 
 
 
368 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000649768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  21.63 
 
 
360 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  23.49 
 
 
377 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.06 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  25.55 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  23.74 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  23.45 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  25 
 
 
355 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>