148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0503 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0503  L-threonine synthase  100 
 
 
412 aa  849    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2977  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  54.96 
 
 
422 aa  427  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717482  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0111  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  57.25 
 
 
430 aa  427  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.726642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3541  L-threonine synthase  52.78 
 
 
416 aa  420  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0314915  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2734  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.55 
 
 
425 aa  391  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2116  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  51.47 
 
 
424 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1454  L-threonine synthase  47.39 
 
 
417 aa  335  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.199227  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0680  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  47.04 
 
 
431 aa  324  2e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.8 
 
 
427 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  24.31 
 
 
403 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  24.06 
 
 
404 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  24.31 
 
 
404 aa  87  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  27.8 
 
 
545 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  24.65 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  24.18 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  22.98 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  23.74 
 
 
401 aa  84  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  24.63 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  23.68 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  22.66 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  24.45 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  22.06 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  24.38 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  21.7 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  26.37 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  23.75 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  25.19 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  24 
 
 
430 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  24.56 
 
 
454 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  22.83 
 
 
348 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  23.81 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  23.31 
 
 
359 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  22.83 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  25.64 
 
 
423 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  23.91 
 
 
432 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  22.49 
 
 
359 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  23.91 
 
 
432 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  23.1 
 
 
408 aa  60.1  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  23.87 
 
 
403 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  22.6 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  23.15 
 
 
437 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  22.22 
 
 
441 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0596  threonine synthase  23.1 
 
 
380 aa  56.6  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  25.17 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  23.86 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  23.57 
 
 
366 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  24.29 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  24.4 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  23.71 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  21.99 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  21.99 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1395  threonine synthase  24.44 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  22.29 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  22.07 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  24.42 
 
 
353 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  22.22 
 
 
352 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  22.22 
 
 
352 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  22.22 
 
 
352 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  23.92 
 
 
346 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  23.4 
 
 
354 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  21.59 
 
 
408 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  24.92 
 
 
403 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  22.49 
 
 
377 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  22.51 
 
 
352 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  25.18 
 
 
424 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  23.65 
 
 
351 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  22.22 
 
 
352 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  26.85 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  21.97 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  22.07 
 
 
352 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  22.41 
 
 
374 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  21.77 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  22.81 
 
 
352 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  27.81 
 
 
413 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  22.56 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  21.93 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  23.01 
 
 
361 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  23.41 
 
 
394 aa  50.8  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  25.73 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  23.14 
 
 
352 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  25.42 
 
 
421 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  23.45 
 
 
370 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  20.6 
 
 
360 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  20.6 
 
 
360 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  20.6 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  22.48 
 
 
427 aa  50.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  22.6 
 
 
422 aa  50.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  23.63 
 
 
346 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19330  L-threonine synthase  24.24 
 
 
352 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  21.74 
 
 
356 aa  50.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  23.28 
 
 
348 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  22.41 
 
 
354 aa  50.1  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  22.85 
 
 
419 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  24.05 
 
 
348 aa  49.7  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  22.22 
 
 
414 aa  49.7  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  23.19 
 
 
348 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1440  threonine synthase  23.61 
 
 
379 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124795  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3650  threonine synthase  22.68 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  22.11 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  22.92 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>