169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3541 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3541  L-threonine synthase  100 
 
 		 416 aa  858    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0314915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0111  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  55.39 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.726642  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0503  L-threonine synthase  52.78 
 
 		 412 aa  420  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2977  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50.48 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1454  L-threonine synthase  51.31 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.199227  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2734  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  50.95 
 
 		 425 aa  398  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2116  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  52.17 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0680  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  48.63 
 
 		 431 aa  352  7e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2716  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.75 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  26.33 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  27.09 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  28.97 
 
 		 545 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  25.06 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  25.57 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  25.32 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  24.56 
 
 		 404 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  26.24 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  25.79 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  26.48 
 
 		 430 aa  86.3  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  23.92 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  26.62 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  24.63 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  25 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  25.87 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  25.87 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  24.5 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  25.06 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  24.36 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  26.63 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  26.63 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  25.94 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  26.11 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  25.76 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  30.95 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  23.15 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  23.56 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  23.23 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  26.14 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  24.21 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  25 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  25.07 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  26.4 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  24.38 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  25 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  24.76 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  24.76 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  24.76 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  24.18 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  24.84 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  24.79 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  24.86 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  25.28 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  25.28 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  25 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  23.67 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  23.77 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  23.96 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  25.35 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  24.5 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  24.62 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  23.18 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  25 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  25.77 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  23.51 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  22.67 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  24.59 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  25.08 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  24.86 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  25.47 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  25.48 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  23.74 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  24.36 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  22.56 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  25.95 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2355  threonine synthase  25.23 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000649768 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08030  threonine synthase  24.13 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  22.68 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  22.6 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  24.58 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  21.96 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  25.57 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  25.07 
 
 		 363 aa  57  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  23.8 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  25.64 
 
 		 347 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  22.62 
 
 		 370 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  23.4 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  21.5 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  23.71 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  23.78 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  24 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  23.14 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  23.78 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  24 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19330  L-threonine synthase  22.8 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  23.61 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  21.61 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  24.71 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  23.22 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  24 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  24.39 
 
 		 360 aa  53.5  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>