More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0928 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3121  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  83 
 
 		 447 aa  731    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0928  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  100 
 
 		 447 aa  894    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1974  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  68.69 
 
 		 414 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2074  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  65.98 
 
 		 451 aa  540  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.139696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2507  RimK domain protein ATP-grasp  51.04 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.451743 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.21 
 
 		 296 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.43 
 
 		 288 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.55 
 
 		 295 aa  97.4  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  34.8 
 
 		 292 aa  96.7  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  29.19 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.2 
 
 		 294 aa  91.7  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1691  SSU ribosomal protein S6P modification protein  38.65 
 
 		 314 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.16 
 
 		 314 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.13 
 
 		 282 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.93 
 
 		 285 aa  89  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  29.31 
 
 		 292 aa  88.2  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.66 
 
 		 296 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  25.74 
 
 		 294 aa  87.4  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  46.15 
 
 		 301 aa  87  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  27.59 
 
 		 293 aa  86.7  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  29.35 
 
 		 299 aa  86.7  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.95 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2113  alpha-L-glutamate ligase  38.16 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795675  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  28.44 
 
 		 292 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0151  alpha-L-glutamate ligase  26.99 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.751724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  45.19 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2165  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  38.16 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.8 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  39.84 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0628  alpha-L-glutamate ligase  29.68 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.31 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.38 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  29.02 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.77 
 
 		 302 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.17 
 
 		 283 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.16 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  28.44 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  33.67 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1015  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.86 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000921126  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0259  S6 modification enzyme RimK  32.16 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.43 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0506  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.49 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  34.8 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.8 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  31.63 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  30.1 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.71 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  26.48 
 
 		 292 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  39.17 
 
 		 292 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.22 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.57 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0546  alpha-L-glutamate ligase  34.36 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.37 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3484  alpha-L-glutamate ligase  34.36 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  35.42 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  31.02 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  32.38 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  30.18 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1783  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.31 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0099597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  26.67 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.53 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6485  alpha-L-glutamate ligase  31.86 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.5 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  36.45 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.43 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.43 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  29.63 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0546  ribosomal protein S6 modification protein  34.16 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  38.98 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.46 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.14 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  38.02 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.73 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  33.74 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.66 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  39.34 
 
 		 265 aa  75.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  33.59 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  33.59 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21920  RimK-like protein  40.38 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0852539  normal  0.847097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  30.39 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3819  alpha-L-glutamate ligase  34.36 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3763  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.36 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.86581 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  32.8 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  35.17 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.53 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  32.14 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  35.17 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1999  ribosomal protein S6 modification protein, putative  27.6 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000304708  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3160  ribosomal protein S6 modification protein  39.02 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  36.28 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0505  alpha-L-glutamate ligase  34.36 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3945  alpha-L-glutamate ligase  35.37 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.5 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.81 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  34.69 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2322  RimK domain-containing protein ATP-grasp  25.7 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  33.16 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  33.16 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  33.16 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  33.16 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>