53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15500 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  353  7.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  46.62 
 
 
200 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  44.76 
 
 
192 aa  127  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  38.51 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  40.29 
 
 
465 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  39.26 
 
 
205 aa  100  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1616  hypothetical protein  31.91 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  32.58 
 
 
202 aa  97.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  34.32 
 
 
197 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2922  hypothetical protein  35.62 
 
 
197 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0548  hypothetical protein  33.15 
 
 
195 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203729  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  31.94 
 
 
195 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  37.1 
 
 
299 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0488  hypothetical protein  31.4 
 
 
190 aa  84.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  28.98 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2284  spore germination protein-like protein  44.33 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000667931  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  34.68 
 
 
245 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2050  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  27.91 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  29.92 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  29.86 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  35.54 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  24.7 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2833  hypothetical protein  32.97 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.458262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  32.5 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1412  hypothetical protein  32.47 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0927892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2508  hypothetical protein  35.85 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.56 
 
 
383 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  28.9 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  35.79 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  29.66 
 
 
239 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  31.09 
 
 
390 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3344  PT repeat-containing protein  29.29 
 
 
514 aa  57.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  22.86 
 
 
484 aa  57.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  29.45 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1663  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  37.76 
 
 
600 aa  52  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  26.87 
 
 
335 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4378  germination protein gerM  37.37 
 
 
349 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.980173  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4219  germination protein  37.37 
 
 
349 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.54501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4716  germination protein gerM  37.37 
 
 
349 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000337184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4235  germination protein  37.37 
 
 
349 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4587  germination protein gerM  37.37 
 
 
349 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0810796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1813  hypothetical protein  25.34 
 
 
545 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4622  germination protein gerM  37.37 
 
 
349 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000451996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4602  germination protein gerM  39.58 
 
 
349 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0633  germination protein gerM  37.37 
 
 
349 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000428784  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4572  germination protein gerM  38.3 
 
 
349 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  30.56 
 
 
309 aa  48.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  34.57 
 
 
397 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2606  hypothetical protein  28.18 
 
 
543 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.886072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4326  germination protein GerM  34.34 
 
 
349 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1855  hypothetical protein  25.25 
 
 
197 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.882537  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  24.35 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0821  hypothetical protein  24.22 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>