More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5381 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
250 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 
254 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  36.75 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  34.17 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 
254 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  36.71 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 
254 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
253 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
253 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  34.6 
 
 
252 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
252 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
239 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
239 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 
249 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 
249 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 
249 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  29.06 
 
 
249 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  28.21 
 
 
249 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
261 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  35 
 
 
255 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
249 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
248 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 
249 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
254 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
254 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
258 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  27.04 
 
 
249 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
277 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
243 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
252 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  27.78 
 
 
249 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  28.7 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 
243 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 
246 aa  99.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 
311 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
247 aa  99  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  29.83 
 
 
243 aa  98.6  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.76 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  33.62 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  26.5 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
261 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
267 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.691417  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
269 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  33.33 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  34.34 
 
 
239 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00179  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G11240)  31.53 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983253  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0530  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  35.98 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0872  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.53 
 
 
247 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4780  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
227 aa  92.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
289 aa  92  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
247 aa  92  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.04 
 
 
239 aa  92.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.53 
 
 
247 aa  92  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
248 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961994  normal  0.547574 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
260 aa  92  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
257 aa  92  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  31.11 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.33 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.99 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>