90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4098 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4098  protein of unknown function UPF0227  100 
 
 
222 aa  447  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0135  protein of unknown function UPF0227  38.43 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0132  protein of unknown function UPF0227  37.93 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.440551  hitchhiker  0.0000000954344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1379  protein of unknown function UPF0227  34.63 
 
 
214 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.510697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0776  protein of unknown function UPF0227  35.21 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0773  hypothetical protein  36.06 
 
 
212 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225043  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2243  hypothetical protein  32.84 
 
 
217 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0766  protein of unknown function UPF0227  34.33 
 
 
213 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0766  protein of unknown function UPF0227  34.33 
 
 
213 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4570  hypothetical protein  34.52 
 
 
211 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00703325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0729  hypothetical protein  34.33 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151283  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1349  hypothetical protein  31.84 
 
 
228 aa  95.9  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108709  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3559  hypothetical protein  36.04 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
273 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
299 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  29.47 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  29.47 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  25.24 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  22.15 
 
 
260 aa  49.7  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2615  protein of unknown function UPF0227  41.76 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3025  protein of unknown function UPF0227  41.76 
 
 
207 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  42.19 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3900  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4177  hypothetical protein  31.3 
 
 
205 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  30.37 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2781  hypothetical protein  40.66 
 
 
210 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00773  hypothetical protein  27.27 
 
 
175 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0101845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2009  esterase YqiA  31.9 
 
 
195 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001762  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0757  hypothetical protein  32.43 
 
 
191 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.168222  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0548  hypothetical protein  30.25 
 
 
192 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0729  hypothetical protein  31.53 
 
 
191 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 
346 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2933  alpha/beta hydrolase fold protein  46.03 
 
 
260 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  hitchhiker  0.000486055 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3232  hypothetical protein  32.43 
 
 
191 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4625  alpha/beta hydrolase fold protein  50.91 
 
 
278 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.178751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  47.92 
 
 
307 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1295  protein of unknown function UPF0227  26.85 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.507685  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20960  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.02 
 
 
269 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.36 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0605  hypothetical protein  40.48 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  32.8 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3328  hypothetical protein  30.63 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.33198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0792  hypothetical protein  27.36 
 
 
167 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1247  hypothetical protein  22.53 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  28.31 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  22.52 
 
 
279 aa  44.3  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  28.65 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0550  hypothetical protein  32.14 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65670  hypothetical protein  40.74 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2233  3-oxoadipate enol-lactonase  27.37 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  57.14 
 
 
326 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0841  alpha/beta family hydrolase  42.86 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0266055 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4191  hypothetical protein  30.63 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2671  esterase YqiA  29.09 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  51.02 
 
 
316 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1108  alpha/beta hydrolase fold  51.72 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  51.02 
 
 
299 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1826  hypothetical protein  28.89 
 
 
167 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25940  hypothetical protein  28.8 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.375139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2832  hypothetical protein  27.4 
 
 
171 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0989794  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  28.93 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3059  hypothetical protein  36.63 
 
 
199 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0763201  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0817  hypothetical protein  27.78 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.45898  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4964  hypothetical protein  31.25 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 
323 aa  42.4  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00570  conserved hypothetical protein  40.54 
 
 
634 aa  42  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.351381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  65.52 
 
 
293 aa  42  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 
239 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4526  alpha/beta hydrolase fold  56.25 
 
 
266 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580548  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5697  hypothetical protein  38.37 
 
 
206 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
278 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  48.98 
 
 
299 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  48.98 
 
 
299 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  48.98 
 
 
299 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03961  proline iminopeptidase  27.7 
 
 
313 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0785  hypothetical protein  28.83 
 
 
191 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.841402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  48.98 
 
 
299 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  48.98 
 
 
299 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  48.98 
 
 
299 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
312 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  52.38 
 
 
256 aa  41.6  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0810  protein of unknown function UPF0227  28.83 
 
 
191 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0617063  unclonable  0.00000000000196592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  45.61 
 
 
288 aa  41.6  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
290 aa  41.6  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  61.29 
 
 
283 aa  41.6  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
310 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
265 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>