25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1826 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1826  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  338  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2832  hypothetical protein  54.04 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0989794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0792  hypothetical protein  48.19 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00184  hypothetical protein  38.36 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4685  hypothetical protein  41.76 
 
 		 189 aa  120  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0057537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0355  hypothetical protein  35.58 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00773  hypothetical protein  36.87 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0101845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1321  hypothetical protein  30.73 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193579  normal  0.134075 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2126  hypothetical protein  32.72 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.742072  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2216  hypothetical protein  32.72 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173018  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0278  hypothetical protein  35.11 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.126418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44320  hypothetical protein  37.31 
 
 		 210 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3772  hypothetical protein  37.69 
 
 		 210 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20020  hypothetical protein  35.61 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2005  hypothetical protein  40.82 
 
 		 330 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654426  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3412  hypothetical protein  40.82 
 
 		 262 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16635  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1619  hypothetical protein  34.62 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4249  hypothetical protein  34.62 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3568  hypothetical protein  38.1 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3815  hypothetical protein  38.24 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.949374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4098  protein of unknown function UPF0227  28.89 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0149  hypothetical protein  39.47 
 
 		 260 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.836313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3910  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  36.11 
 
 		 252 aa  40.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>