87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4249 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4249  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.962875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1619  hypothetical protein  97.39 
 
 		 230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0828333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3815  hypothetical protein  96.05 
 
 		 231 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.949374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3568  hypothetical protein  87.34 
 
 		 230 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1828  hypothetical protein  71.49 
 
 		 224 aa  317  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2598  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  70.61 
 
 		 224 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000600311  normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2005  hypothetical protein  66.38 
 
 		 330 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3772  hypothetical protein  75.51 
 
 		 210 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44320  hypothetical protein  75.92 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3412  hypothetical protein  65.5 
 
 		 262 aa  292  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.16635  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20020  hypothetical protein  71.35 
 
 		 213 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1152  hypothetical protein  48.96 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.426204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4300  hypothetical protein  51.76 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0262079  normal  0.176496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19031  esterase/lipase/thioesterase family protein  47.6 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.182153 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01184  hypothetical protein  48.97 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0542  hydrolase with alpha/beta-hydrolase fold  47.42 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.52739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004251  alpha/beta hydrolase  45.83 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000929244  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7072  putative hydrolase protein  48.48 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00102074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1086  putative hydrolase protein  49.03 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5935  putative hydrolase protein  48.98 
 
 		 212 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636652  normal  0.167622 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2428  hypothetical protein  47.45 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.781961  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3543  hypothetical protein  43.75 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.074661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02565  predicted hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  41.84 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0958  esterase/lipase/thioesterase family protein  46.11 
 
 		 185 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.800343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1783  alpha/beta fold family hydrolase  46.89 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2202  hypothetical protein  42.63 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.101227  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1365  hypothetical protein  43.59 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.159458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1390  hypothetical protein  43.08 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.136922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1351  hypothetical protein  43.08 
 
 		 214 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1283  hypothetical protein  42.13 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0971816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3470  dienelactone hydrolase  37.7 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00399877  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2995  hypothetical protein  42.05 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  hitchhiker  0.00000185469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2794  hypothetical protein  40.51 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00486686  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2763  dienelactone hydrolase  39.81 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.545156  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2893  hypothetical protein  41.03 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000793472  hitchhiker  0.00000470517 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3321  dienelactone hydrolase  37.17 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000206123  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2723  hypothetical protein  41.54 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000147001  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2983  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  37.82 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1534  hypothetical protein  38.46 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2564  hypothetical protein  37.98 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2782  hypothetical protein  36.54 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0438432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2235  putative hydrolase protein  37.5 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0877  hypothetical protein  42.05 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000539419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5819  hypothetical protein  36.36 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2029  dienelactone hydrolase  39.31 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0251509  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1786  dienelactone hydrolase  35.84 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000570181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3497  hypothetical protein  36.05 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.427254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1145  hypothetical protein  37.44 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7505  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30750  hypothetical protein  36.42 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0543148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0532  hypothetical protein  36.23 
 
 		 202 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0527  hypothetical protein  35.75 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.872907  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0359  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  37.65 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2472  hypothetical protein  33.53 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.26433 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3178  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  31.58 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0182  hypothetical protein  34.29 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3442  hypothetical protein  35.03 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0499  hypothetical protein  42.34 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0723  hypothetical protein  31.61 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1705  hypothetical protein  29.84 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0382179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2903  hypothetical protein  33.73 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3083  hypothetical protein  35.86 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10426  hypothetical protein  30.8 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.393398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3866  dienelactone hydrolase  34.32 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.708353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4096  hypothetical protein  37.41 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4921  hypothetical protein  36.23 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6032  hypothetical protein  33.52 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0553  hypothetical protein  29.71 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.981391  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0563  hypothetical protein  29.71 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0575  hypothetical protein  29.71 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  hitchhiker  0.00774359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0960  hypothetical protein  34.08 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.796959  normal  0.0488805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6294  hypothetical protein  41.67 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5559  hypothetical protein  33.7 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4023  alpha/beta fold family hydrolase  32.35 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336562  normal  0.117337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2337  hypothetical protein  29.56 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.207577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3769  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  32.89 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.200411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2427  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  35.46 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00151914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2476  hypothetical protein  33.9 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4010  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  30.56 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0201366  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3074  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold family  32.35 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120291  decreased coverage  0.0000000220174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3001  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  32.67 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.044134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3715  hypothetical protein  35.45 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  35.09 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  29.71 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1826  hypothetical protein  34.62 
 
 		 167 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1700  hypothetical protein  34.75 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.62359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  32.08 
 
 		 274 aa  42  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>