23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0792 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0792  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  343  7e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00184  hypothetical protein  48.73 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2832  hypothetical protein  49.69 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0989794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4685  hypothetical protein  49.72 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0057537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1826  hypothetical protein  48.19 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1321  hypothetical protein  40.34 
 
 		 175 aa  110  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193579  normal  0.134075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00773  hypothetical protein  39.77 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0101845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0355  hypothetical protein  35.88 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2216  hypothetical protein  37.97 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173018  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2126  hypothetical protein  37.97 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.742072  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0766  protein of unknown function UPF0227  29.38 
 
 		 213 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0766  protein of unknown function UPF0227  29.38 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182616  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  31.01 
 
 		 252 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0729  hypothetical protein  29.58 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151283  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4098  protein of unknown function UPF0227  27.36 
 
 		 222 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  28.21 
 
 		 252 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  26.03 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  31.82 
 
 		 259 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  31.82 
 
 		 259 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2714  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  42  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  29.29 
 
 		 260 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4761  hypothetical protein  33.63 
 
 		 230 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4957  hypothetical protein  34.82 
 
 		 232 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0732441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>