124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1247 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1247  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  414  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1294  protein of unknown function UPF0227  35.57 
 
 
184 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.497416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0434  hypothetical protein  34.87 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4177  hypothetical protein  30.88 
 
 
205 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0584  protein of unknown function UPF0227  32.82 
 
 
187 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3044  hypothetical protein  36.5 
 
 
191 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.93923 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0037  protein of unknown function UPF0227  29.74 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3444  esterase YqiA  31.31 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4264  esterase YqiA  32.5 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0548  hypothetical protein  32.16 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3615  esterase YqiA  33.51 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02903  predicted esterase  34.22 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0669  protein of unknown function UPF0227  34.22 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02853  hypothetical protein  34.22 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4345  esterase YqiA  34.22 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0577  esterase YqiA  30.2 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3209  esterase YqiA  34.22 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.451681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3495  esterase YqiA  34.22 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0280  esterase YqiA  30.2 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0658  esterase YqiA  30.2 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0666  esterase YqiA  34.22 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3326  esterase YqiA  34.22 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.901515  normal  0.753431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65670  hypothetical protein  31.44 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2671  esterase YqiA  31.63 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2574  esterase  33.69 
 
 
185 aa  89  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3910  hypothetical protein  31.25 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0537  esterase  32.67 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3675  protein of unknown function UPF0227  29.76 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3535  esterase YqiA  31.53 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3363  esterase YqiA  31.53 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.321525  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3440  esterase YqiA  31.53 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3433  esterase YqiA  31.53 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3368  esterase YqiA  31.53 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4191  hypothetical protein  35.48 
 
 
192 aa  88.6  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3357  hypothetical protein  30.61 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0517528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2284  hydrolase, putative  31.18 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3773  esterase YqiA  32.45 
 
 
193 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3464  esterase YqiA  33.69 
 
 
193 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4708  hypothetical protein  30.2 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.731095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03686  predicted esterase  31.68 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.040582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4969  hypothetical protein  29.7 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5697  hypothetical protein  30.61 
 
 
206 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3421  protein of unknown function UPF0227  31.19 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1485  hypothetical protein  31.12 
 
 
194 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43490  hypothetical protein  30.1 
 
 
205 aa  84.7  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0318  esterase YqiA  33.16 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0778  hypothetical protein  32.09 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0337067  hitchhiker  0.0000000017764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3559  hypothetical protein  35.14 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4916  hypothetical protein  28.87 
 
 
247 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4964  hypothetical protein  30.77 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2009  esterase YqiA  27.64 
 
 
195 aa  82  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2624  hypothetical protein  31.68 
 
 
200 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4792  hypothetical protein  28.36 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528676  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004518  putative esterase  29.59 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3221  hypothetical protein  32.16 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3059  hypothetical protein  31.47 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0763201  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0327  esterase YqiA  32.09 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3900  hypothetical protein  31.72 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0959  hypothetical protein  30.35 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3555  hypothetical protein  30.07 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0761566  normal  0.0880721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0772  hypothetical protein  31.35 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.40876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2615  protein of unknown function UPF0227  30.61 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3574  hypothetical protein  30.1 
 
 
191 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.819327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0605  hypothetical protein  29.15 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0498  hypothetical protein  29.23 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0810  protein of unknown function UPF0227  30.46 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0617063  unclonable  0.00000000000196592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3232  hypothetical protein  31.02 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0817  hypothetical protein  29.59 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.45898  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0550  hypothetical protein  29.47 
 
 
205 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0757  hypothetical protein  31.02 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.168222  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0785  hypothetical protein  29.95 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.841402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0729  hypothetical protein  31.02 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799226 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3401  hypothetical protein  29.08 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.435883  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3198  hypothetical protein  29.9 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0845  hypothetical protein  29.17 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.294415  normal  0.359517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0989  hypothetical protein  29.17 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.271686  normal  0.405619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0845  hypothetical protein  31.35 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.126396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2781  hypothetical protein  30.26 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3328  hypothetical protein  29.35 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.33198  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3025  protein of unknown function UPF0227  30.1 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3375  hypothetical protein  26.63 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2545  hypothetical protein  31.98 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2959  protein of unknown function UPF0227  30.3 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0148582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1090  hypothetical protein  27.04 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3649  hypothetical protein  29.95 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0512  hypothetical protein  29.23 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0536  hypothetical protein  29.74 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.975326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00873  esterase YqiA  32 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2774  hypothetical protein  28.93 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0579  hypothetical protein  30.26 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3693  hypothetical protein  29.23 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.695003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0128  hypothetical protein  29.74 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0611  hypothetical protein  29.74 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3978  hypothetical protein  25.6 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00232425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0938  protein of unknown function UPF0227  26.2 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.330656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0373  DNA repair protein RadA  26.6 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2496  hypothetical protein  27.32 
 
 
189 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0562074  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1276  hypothetical protein  27.32 
 
 
189 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3460  hypothetical protein  27.32 
 
 
189 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3498  hypothetical protein  27.32 
 
 
189 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>