69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3773 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 421 aa  813    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.58 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 160 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  29.7 
 
 		 123 aa  53.1  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  39.71 
 
 		 166 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  36 
 
 		 114 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  35.8 
 
 		 163 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 103 aa  50.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 163 aa  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 121 aa  50.1  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 134 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 137 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 		 192 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 163 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  26.61 
 
 		 149 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.85 
 
 		 153 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  30.3 
 
 		 115 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.01 
 
 		 166 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  35.96 
 
 		 177 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 138 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 163 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 140 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.19 
 
 		 116 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  33.78 
 
 		 167 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0542  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.44 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 165 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 112 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2644  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.49 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.789787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  37.14 
 
 		 162 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2625  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.51 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0948  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  27.71 
 
 		 505 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  34.38 
 
 		 155 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  33.82 
 
 		 152 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3705  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.51 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  28.4 
 
 		 121 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 111 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 135 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  33.78 
 
 		 167 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 125 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0919  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.51 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1090  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.09 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.69906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4544  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.51 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3819  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.51 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2487  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.51 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0301  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.29 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.503708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 149 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4920  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.51 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0212238 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 204 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1897  alginate biosynthesis protein  27.71 
 
 		 476 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0297962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2277  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  26.51 
 
 		 508 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2012  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  27.71 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  36.62 
 
 		 179 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5545  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.51 
 
 		 508 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3722  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.51 
 
 		 508 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.401083  normal  0.0704919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2173  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  25.64 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0774935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2389  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  24.14 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.717093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  32.69 
 
 		 150 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 		 137 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 152 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  26.76 
 
 		 143 aa  43.1  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 204 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.75 
 
 		 153 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2869  hypothetical protein  32.93 
 
 		 112 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.175305  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4053  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  26.44 
 
 		 475 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 		 377 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3039  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  26.67 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1254  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  26.67 
 
 		 468 aa  43.1  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000457792  hitchhiker  0.00000000000165739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>