More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3441 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3441  protein of unknown function DUF140  100 
 
 
258 aa  496  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  40.8 
 
 
270 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  37.35 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  39.6 
 
 
260 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  38.74 
 
 
268 aa  155  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  39.91 
 
 
258 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  36.58 
 
 
260 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  36.58 
 
 
260 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  35.04 
 
 
258 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  38.46 
 
 
256 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  35.04 
 
 
258 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  36.57 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  37.78 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  34.66 
 
 
257 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  37.5 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  38.04 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  37.5 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  39.22 
 
 
257 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  37.85 
 
 
375 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  39.02 
 
 
261 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  33.86 
 
 
266 aa  142  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  34.27 
 
 
269 aa  141  9e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  34.25 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  34.39 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  36.8 
 
 
248 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  34.72 
 
 
255 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  36.36 
 
 
264 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  32.13 
 
 
260 aa  137  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  35.55 
 
 
266 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  35.56 
 
 
250 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  32.77 
 
 
268 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  33.6 
 
 
250 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  32.02 
 
 
261 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  37.32 
 
 
380 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  34.3 
 
 
247 aa  136  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  37.78 
 
 
249 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  34.74 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  33.94 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  35.5 
 
 
263 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  35.5 
 
 
263 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  34.92 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  36.15 
 
 
258 aa  132  6e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  37.5 
 
 
413 aa  132  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  37.14 
 
 
263 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  34.89 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  32.82 
 
 
263 aa  131  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  36.07 
 
 
266 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0924  ABC transporter, permease protein, putative  38.77 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  34.1 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  34.42 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  33.86 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  32.56 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  35.29 
 
 
378 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  34.68 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  35.59 
 
 
377 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  34.68 
 
 
251 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  35.5 
 
 
265 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  31.4 
 
 
270 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  34.68 
 
 
251 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  32.58 
 
 
265 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  32.58 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  35.21 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  31.71 
 
 
266 aa  126  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  34.88 
 
 
260 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  34.26 
 
 
265 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05671  putative transporter, membrane component  35.06 
 
 
248 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  37.68 
 
 
382 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  34.88 
 
 
260 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  34.88 
 
 
260 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  34.2 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  33.8 
 
 
265 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  32.94 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  33.8 
 
 
265 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  32.81 
 
 
275 aa  125  9e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  33.8 
 
 
266 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  36 
 
 
258 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  31.75 
 
 
265 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  35.04 
 
 
259 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  34.32 
 
 
261 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  33.8 
 
 
265 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  34.21 
 
 
264 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  32.94 
 
 
255 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  32.94 
 
 
255 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  31.68 
 
 
267 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1422  putative transporter, membrane component  32.88 
 
 
251 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  32.43 
 
 
260 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15101  putative transporter, membrane component  33.33 
 
 
251 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  32.93 
 
 
265 aa  122  4e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15241  putative transporter, membrane component  32.88 
 
 
251 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0680677  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  33.96 
 
 
234 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03210  toluene tolerance protein  33.33 
 
 
249 aa  123  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  32.53 
 
 
376 aa  122  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  32.54 
 
 
255 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>