More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3195 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  100 
 
 		 285 aa  568  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  49.62 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  55.56 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  41.63 
 
 		 243 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  41.25 
 
 		 243 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  44.25 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  47.16 
 
 		 248 aa  211  9e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  46.52 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  46.29 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  38.67 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  42.67 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  35.69 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  42.29 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  42.29 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  41.38 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  41.41 
 
 		 244 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  41.67 
 
 		 244 aa  188  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  41.23 
 
 		 244 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  41.78 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  41.23 
 
 		 244 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  41.23 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  42.29 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  40.17 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  41.38 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  43.44 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  41.85 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  40.44 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  42.79 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  40.84 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  41.78 
 
 		 244 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  40.09 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  40.38 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  39.81 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  36.12 
 
 		 251 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  39.66 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  37.21 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  40.62 
 
 		 240 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  44.55 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  39.83 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  39.25 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  38.99 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  40.38 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  41.39 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  40.51 
 
 		 334 aa  165  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  37.07 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  37.07 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  42.86 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  39.27 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  39.17 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  41.63 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  36.62 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  38.27 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  39.37 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  37.56 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.21 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  37.67 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.14 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  34.42 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  40.53 
 
 		 259 aa  159  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  37.65 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  36.28 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.32 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.46 
 
 		 907 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  39.09 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.38 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.07 
 
 		 411 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  37.04 
 
 		 904 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  32.62 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  32.62 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.85 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  34.25 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 341 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  32.74 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.91 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.55 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  32.19 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  32.19 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  32.19 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  32.19 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  32.19 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  35.45 
 
 		 306 aa  153  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.91 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  39.51 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  39.91 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.19 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  35.63 
 
 		 912 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.24 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  32.19 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>