More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2839 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2839  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
309 aa  612  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  38.73 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  38.65 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  37.16 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  38.38 
 
 
299 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 
299 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.38 
 
 
299 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.3 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  37.19 
 
 
312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  38.03 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  37.94 
 
 
299 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  37.94 
 
 
299 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  38.55 
 
 
295 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 
326 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 
314 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 
347 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  35.18 
 
 
300 aa  182  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  43.51 
 
 
378 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 
327 aa  179  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  40.34 
 
 
308 aa  178  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2551  cation diffusion facilitator family transporter  37.63 
 
 
309 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  36.33 
 
 
305 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  36.23 
 
 
342 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1837  cation diffusion facilitator family transporter  38.77 
 
 
334 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  37.67 
 
 
321 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0073  cation diffusion facilitator family transporter  35.74 
 
 
329 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0557  cation diffusion facilitator family transporter  35.07 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3953  cation diffusion facilitator family transporter  36.9 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169569  normal  0.0895202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3614  cation diffusion facilitator family transporter  33.76 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.99 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  35.99 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  35.99 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  35.99 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1490  cation diffusion facilitator family transporter  35.2 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0423913 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  38.06 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  42.8 
 
 
328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  42.34 
 
 
306 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1744  cation diffusion facilitator family transporter  35.1 
 
 
319 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  35.83 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  37.82 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 
398 aa  170  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4537  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 
309 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2839  cation diffusion facilitator family transporter  35.4 
 
 
306 aa  169  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3234  cation diffusion facilitator family transporter  34.95 
 
 
323 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.34559  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 
304 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 
352 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0853  zinc transporter ZitB  40.78 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0794  zinc transporter ZitB  40.78 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00320778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0822  zinc transporter ZitB  40.78 
 
 
312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0917  zinc transporter ZitB  40.39 
 
 
312 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0885  zinc transporter ZitB  40.78 
 
 
312 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.288903  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  38.63 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  36.13 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  39.51 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  40.55 
 
 
306 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1362  cation diffusion facilitator family transporter  37.38 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625053  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  32.33 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0853  Hsp12 variant C  36.17 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.401096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0482  cation diffusion facilitator family transporter  36.1 
 
 
372 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  34.73 
 
 
312 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  37.07 
 
 
300 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  37.07 
 
 
300 aa  162  7e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  35.14 
 
 
315 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0911  cation diffusion facilitator family transporter  36.25 
 
 
311 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.344987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  35.64 
 
 
340 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  34.39 
 
 
299 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 
299 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0395  cation diffusion facilitator family transporter  36.59 
 
 
327 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.309924  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 
299 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  33.57 
 
 
312 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3080  zinc transporter ZitB  33.8 
 
 
310 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.448896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0724  cation diffusion facilitator family transporter  38.65 
 
 
373 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  33.69 
 
 
312 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 
305 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  33.69 
 
 
312 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 
305 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  37.68 
 
 
340 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 
307 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4540  cation diffusion facilitator family transporter  36.82 
 
 
346 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.115451 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2104  cation diffusion facilitator family transporter  38.33 
 
 
342 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.20697  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1131  cation diffusion facilitator family transporter  34.27 
 
 
324 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.313186  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0961  cation efflux pump CDF  37.45 
 
 
356 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365003  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1490  cation diffusion facilitator family transporter  36.76 
 
 
337 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.176573  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  37.29 
 
 
308 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1221  cation diffusion facilitator family transporter  37.71 
 
 
306 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  36.7 
 
 
342 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1768  cation diffusion facilitator family transporter  36.76 
 
 
339 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.149707 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  32.52 
 
 
317 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  39.02 
 
 
309 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4073  cation diffusion facilitator family transporter  36.33 
 
 
318 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  36.4 
 
 
325 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  36.4 
 
 
325 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  35.49 
 
 
333 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3026  cation diffusion facilitator family transporter  36.43 
 
 
366 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570662  normal  0.0173078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  34.87 
 
 
305 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 
305 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0219  cation diffusion facilitator family transporter  34.47 
 
 
314 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0328  cation diffusion facilitator family transporter  34.91 
 
 
329 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>