113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2212 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  100 
 
 
159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  67.09 
 
 
182 aa  213  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  62.5 
 
 
179 aa  201  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5418  hypothetical protein  64.29 
 
 
180 aa  201  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2612  OsmC family protein  63.64 
 
 
208 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  61.29 
 
 
190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  60 
 
 
176 aa  189  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  56.96 
 
 
185 aa  183  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  56.33 
 
 
185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  54.43 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  55.13 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4668  OsmC family protein  47.17 
 
 
183 aa  151  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1310  OsmC family protein  46.54 
 
 
183 aa  148  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47097  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1151  OsmC family protein  46.54 
 
 
183 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.824502  normal  0.359642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2175  OsmC-like protein  46.54 
 
 
185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.416909  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4851  OsmC-like protein  45.28 
 
 
187 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.137347 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  40.35 
 
 
186 aa  90.9  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  44.14 
 
 
189 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  41.13 
 
 
179 aa  89.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  31.76 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  42.34 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  39.29 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  41.44 
 
 
182 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  36.61 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  38.14 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  36.61 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  36.67 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  37.5 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  33.33 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  38.53 
 
 
186 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  32.23 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  36.67 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  36.28 
 
 
202 aa  70.9  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  32.86 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  34.17 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  36.7 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  36.7 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  36.7 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  36.7 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  36.7 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  33.61 
 
 
185 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  33.33 
 
 
171 aa  67.4  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  29.82 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  33.9 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  35.29 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  31.85 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  29.41 
 
 
202 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  33.04 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  31.25 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  32.5 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  41.56 
 
 
190 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  33.57 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  29.6 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.97 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  29.82 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  36.05 
 
 
199 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  26.77 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  30.22 
 
 
144 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  30.23 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  29.27 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  29 
 
 
193 aa  53.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  30.33 
 
 
135 aa  53.9  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  31.51 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  29.49 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1148  OsmC family protein  35.64 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  30.52 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  28.85 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  36.25 
 
 
172 aa  50.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  25.35 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  34.07 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  31.19 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  34.48 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  25.17 
 
 
410 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  25.89 
 
 
145 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  29.75 
 
 
412 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  31.4 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  24.5 
 
 
410 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  22.61 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2031  OsmC family protein  26.13 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.650355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  29.41 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1255  OsmC-like protein  27.56 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6577  OsmC family protein  27.56 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1639  OsmC family protein  29.63 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.945103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  34.07 
 
 
169 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6182  OsmC family protein  27.56 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.360981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  22.61 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  22.61 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  22.03 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7506  hypothetical protein  26.99 
 
 
188 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101926  normal  0.551931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0112  OsmC-like protein  36.23 
 
 
169 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.636366  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  29.51 
 
 
130 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  24.35 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7644  hypothetical protein  30.47 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0203  OsmC family protein  27.78 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0158527  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  28.69 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2892  OsmC family protein  28.57 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.851644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  21.74 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0031  OsmC-like protein  28.57 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0225  OsmC-like protein  35.29 
 
 
169 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.439807  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  27.87 
 
 
130 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>