More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2119 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
256 aa  513  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  62.3 
 
 
244 aa  311  6.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  62.3 
 
 
244 aa  310  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  57.2 
 
 
297 aa  273  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  58.27 
 
 
251 aa  269  4e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  38.49 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  38.74 
 
 
251 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  38.15 
 
 
255 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  29.34 
 
 
263 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1471  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 
244 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0655  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 
244 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000122219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  30.59 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1120  metallo-beta-lactamase family protein  30.74 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2205  beta-lactamase domain protein  34.66 
 
 
246 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  30.74 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  29.96 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
251 aa  95.5  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0158649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1000  metal-dependant hydrolase  29.2 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  33.06 
 
 
251 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1247  metallo-beta-lactamase family protein  29.2 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1016  hypothetical protein  28.8 
 
 
244 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1088  hypothetical protein  28.8 
 
 
244 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1005  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1003  metal-dependant hydrolase  28.8 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  33.17 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1166  metallo-beta-lactamase family protein  28.4 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.84 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  28.83 
 
 
300 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  31.62 
 
 
268 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.21 
 
 
306 aa  86.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3374  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285355  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  30.2 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.28 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  26.28 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  26.28 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  28.3 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  26.28 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  26.28 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1012  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  26.28 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0757  beta-lactamase superfamily hydrolase  30.57 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00514678  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  28.42 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  25.9 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  22.68 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  30.53 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1470  metal-dependent hydrolase  25.86 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.518111  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0708  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3155  beta-lactamase-like protein  27.39 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  31.14 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  21.45 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  30.11 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  26.06 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  26 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  26.75 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  30.8 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  29.14 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  29.33 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  29.65 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  30.87 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  32.89 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  28.94 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.63 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  23.93 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  27.17 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  26.45 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  28.68 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  29.85 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  28.85 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2818  ribonuclease Z  33.55 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3973  ribonuclease Z  32.24 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  28.74 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  32.24 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  24.65 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  31.64 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  28.48 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  32.24 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  32.24 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  32.24 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  32.24 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  37.38 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  32.24 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  25.89 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  37.38 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1613  ribonuclease Z  25.67 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  32.24 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  37.38 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  32.24 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1360  ribonuclease Z  24.6 
 
 
316 aa  72  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0966966  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0429  ribonuclease Z  25.33 
 
 
318 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3895  ribonuclease Z  31.58 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  29.85 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>