More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0312 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0312  Thioredoxin domain protein  100 
 
 		 88 aa  180  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1563  Thioredoxin domain protein  86.52 
 
 		 100 aa  157  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851055  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3540  Thioredoxin domain protein  84.27 
 
 		 89 aa  153  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  75 
 
 		 88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0372  Thioredoxin domain protein  74.16 
 
 		 89 aa  140  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  50 
 
 		 88 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3175  thioredoxin-related  49.41 
 
 		 90 aa  87.8  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1024  Thioredoxin domain protein  47.56 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  46.91 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1798  thioredoxin domain-containing protein  49.38 
 
 		 90 aa  84  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.317909  normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  45.68 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  41.18 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1851  thioredoxin-related  46.34 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  44.44 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  42.17 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  45.35 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0210  thioredoxin  44.58 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  43.37 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3919  thioredoxin  45.12 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.566246  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0311  hypothetical protein  42.68 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1129  thioredoxin  49.32 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  42.17 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  52.05 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A34  Thiol-disulfide isomerase  37.21 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0201899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  52.05 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  51.43 
 
 		 282 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  41.67 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  51.43 
 
 		 282 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3391  thioredoxin  44.19 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.522646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  40.48 
 
 		 105 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  37.65 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  50.68 
 
 		 282 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  47.3 
 
 		 282 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  44.58 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  40.74 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1204  thioredoxin  46.43 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  38.1 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1226  thioredoxin  46.43 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  42.86 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  46.15 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  41.46 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  49.32 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  51.43 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  41.46 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  41.67 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0728  thioredoxin  45.24 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2784  thioredoxin  43.37 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0698118 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2662  thioredoxin  44.44 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  6.93824e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  42.31 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  37.35 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2305  thioredoxin  43.02 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.0025384  normal  0.350799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  48.65 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  48.65 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  37.35 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  38.55 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1507  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.35 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000161459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  37.8 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  39.76 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  40.48 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  39.76 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  38.75 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  40.24 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  40.48 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  37.65 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  42.31 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  40.48 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  39.24 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0350  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  37.08 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000162152  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0922  thioredoxin  37.8 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  41.98 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  39.29 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  39.76 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  43.21 
 
 		 280 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  45.24 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  39.53 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  36.14 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3584  thioredoxin  42.35 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00016677  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  40.74 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  40.48 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  38.1 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  38.55 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  37.8 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  41.18 
 
 		 285 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  37.65 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  40.51 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1150  thioredoxin  36.78 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000755865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  40.96 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  41.33 
 
 		 109 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  44.16 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1206  thioredoxin  37.8 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.232039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  40.24 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  38.75 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0739  thioredoxin  38.27 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.186683  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  41.67 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  42.86 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1261  thioredoxin  40 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.262262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>