More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0309 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  100 
 
 
609 aa  1247    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3509  putative ATPase RIL  56.88 
 
 
588 aa  690    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.358923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1332  putative ATPase RIL  54.98 
 
 
590 aa  675    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.178522  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1854  putative ATPase RIL  57.14 
 
 
589 aa  698    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.285578  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3503  ABC transporter related protein  79.97 
 
 
604 aa  1011    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  83.42 
 
 
610 aa  1050    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1568  putative ATPase RIL  54.82 
 
 
589 aa  669    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.268  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1549  ABC transporter related protein  78.33 
 
 
604 aa  997    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.547785  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0007  putative ATPase RIL  56.88 
 
 
584 aa  671    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0397  putative ATPase RIL  78.2 
 
 
606 aa  986    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0939  putative ATPase RIL  56.72 
 
 
589 aa  689    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0542  putative ATPase RIL  52.16 
 
 
600 aa  634  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0356445  normal  0.109277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0435  putative ATPase RIL  53.16 
 
 
588 aa  624  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.985617  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0399  ABC transporter related protein  48.01 
 
 
586 aa  597  1e-169  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0528  putative ATPase RIL  48.59 
 
 
590 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1380  putative ATPase RIL  48.76 
 
 
590 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0776599  normal  0.169573 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1369  putative ATPase RIL  49.09 
 
 
590 aa  591  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0651  putative ATPase RIL  48.1 
 
 
592 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1256  putative ATPase RIL  48.51 
 
 
590 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.811712  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0212  putative ATPase RIL  47.04 
 
 
601 aa  571  1e-161  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0295  putative ATPase RIL  44.63 
 
 
595 aa  558  1e-157  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00910203 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1558  putative ATPase RIL  43.82 
 
 
590 aa  525  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000149119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1496  putative ATPase RIL  43.75 
 
 
590 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2258  putative ATPase RIL  42.34 
 
 
600 aa  514  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.306983 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_1048  phosphatase  41.8 
 
 
623 aa  512  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.495002  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1686  putative ATPase RIL  43.99 
 
 
589 aa  511  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000842642 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29654  predicted protein  41.97 
 
 
611 aa  505  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0190452  normal  0.17762 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0738  putative ATPase RIL  44.89 
 
 
604 aa  508  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0393541 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27256  predicted protein  41.97 
 
 
611 aa  505  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0894318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1264  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
600 aa  505  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.931219  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0625  putative ATPase RIL  42.67 
 
 
590 aa  504  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000179458  hitchhiker  0.000000208503 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07330  hypothetical protein  41.21 
 
 
603 aa  501  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01256  RNase L inhibitor of the ABC superfamily, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10310)  41.39 
 
 
564 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.192444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  25.82 
 
 
530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  27.68 
 
 
543 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  27.65 
 
 
555 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  23.97 
 
 
634 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  28.03 
 
 
545 aa  124  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  23.27 
 
 
620 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.35 
 
 
556 aa  122  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  27.64 
 
 
540 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  27.64 
 
 
540 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  27.31 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.89 
 
 
558 aa  120  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.98 
 
 
559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  24.57 
 
 
636 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  25.55 
 
 
634 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  23.3 
 
 
643 aa  117  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0443  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.38 
 
 
555 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317561  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2713  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.18 
 
 
555 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776803  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3514  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.72 
 
 
554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0491494  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.9 
 
 
553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  24.05 
 
 
606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2924  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.79 
 
 
555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.24 
 
 
561 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.23 
 
 
555 aa  115  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0133  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.57 
 
 
553 aa  115  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0668164  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.63 
 
 
559 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6107  ABC transporter related protein  26.32 
 
 
653 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  24.73 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.26 
 
 
561 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0661  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.98 
 
 
560 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0144  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.19 
 
 
553 aa  114  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.17 
 
 
561 aa  113  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2587  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.68 
 
 
705 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.09 
 
 
561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.15 
 
 
561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  26.47 
 
 
632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0229  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.81 
 
 
555 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0269  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.03 
 
 
561 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.36 
 
 
558 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0489  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  26.17 
 
 
564 aa  111  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0517  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.817295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1934  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
555 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0510  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
555 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2216  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.15 
 
 
547 aa  111  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.885012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3595  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
555 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.431194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  26.73 
 
 
549 aa  111  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0964  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
555 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3606  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
555 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.776726  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.64 
 
 
563 aa  111  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  24.29 
 
 
630 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2626  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.59 
 
 
578 aa  111  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.663821  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0668  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
555 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3581  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.53 
 
 
555 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.078032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  24.85 
 
 
639 aa  110  6e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2881  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.14 
 
 
555 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.41932  normal  0.0832413 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  24.86 
 
 
723 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.83 
 
 
553 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.38 
 
 
555 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2845  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.24 
 
 
559 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.493421  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3604  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.79 
 
 
555 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.03 
 
 
559 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  24.49 
 
 
662 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.48 
 
 
559 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41857  predicted protein  26.6 
 
 
546 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.968452  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2242  putative ABC transporter ATP-binding protein  24.44 
 
 
553 aa  108  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  24.75 
 
 
668 aa  108  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  26.37 
 
 
600 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>