57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0223 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0223  UspA domain protein  100 
 
 		 148 aa  287  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.189341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0966  UspA domain protein  45.27 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1304  UspA domain protein  50.34 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.708291  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1930  UspA domain protein  51.33 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3428  UspA domain protein  48.99 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.65 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  28.68 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  30.92 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  24.48 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30 
 
 		 290 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  30.38 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  34.45 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  34.01 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  34.48 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.19 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  26.28 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  29.73 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  28.28 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  30.14 
 
 		 281 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  26.85 
 
 		 207 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  26.49 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  24.83 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  29.37 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.85 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  27.4 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  30.07 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  30.14 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  28.97 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  27.7 
 
 		 154 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 		 175 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.66 
 
 		 141 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  30.32 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  22.54 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  28.97 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  30.32 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  27.7 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  26.9 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.19 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  30.77 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  25 
 
 		 287 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  27.54 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  32.45 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  25.16 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  31.03 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.14 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  27.7 
 
 		 415 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.35 
 
 		 314 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  31.08 
 
 		 151 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  27.4 
 
 		 151 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  47.37 
 
 		 152 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>