More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1303 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2404  GTP-binding proten HflX  72.77 
 
 
436 aa  636    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.115751  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1303  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
449 aa  893    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1710  GTP-binding proten HflX  69 
 
 
433 aa  604  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0828  GTP-binding proten HflX  68.93 
 
 
439 aa  597  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3318  GTP-binding proten HflX  69.58 
 
 
433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0425639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  46.48 
 
 
413 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0351  GTP-binding protein  47.04 
 
 
436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.304263  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2447  GTP-binding proten HflX  41.49 
 
 
469 aa  211  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0708  small GTP-binding protein  36.49 
 
 
424 aa  210  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131906  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1628  GTP-binding protein, HSR1-related  35.22 
 
 
425 aa  209  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  34.11 
 
 
419 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0139  GTP-binding protein HSR1-related  36.91 
 
 
409 aa  207  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1697  GTPase  35.22 
 
 
429 aa  207  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  6.83128e-22 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1355  GTP-binding protein HflX  37.66 
 
 
435 aa  206  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  34.22 
 
 
419 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  34.07 
 
 
419 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  33.82 
 
 
419 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  34.07 
 
 
419 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  33.58 
 
 
419 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  33.33 
 
 
419 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  34.47 
 
 
419 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  33.64 
 
 
419 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  33.82 
 
 
419 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  35.79 
 
 
421 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  38.28 
 
 
422 aa  203  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  37.29 
 
 
433 aa  203  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  38.5 
 
 
487 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1927  GTP binding protein  33.95 
 
 
597 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.09 
 
 
493 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2215  GTP binding protein  33.95 
 
 
597 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.192025  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0155  GTPase  40.74 
 
 
437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2146  small GTP-binding protein  36.31 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1737  GTP-binding protein, HSR1-related  37.5 
 
 
434 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  35.86 
 
 
395 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  34.79 
 
 
582 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  35.96 
 
 
436 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  34.98 
 
 
434 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  36.72 
 
 
433 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  35.53 
 
 
431 aa  193  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1550  GTP-binding proten HflX  32.38 
 
 
405 aa  193  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.990824  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  35.85 
 
 
437 aa  192  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1075  small GTP-binding protein  36.21 
 
 
372 aa  192  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  37.84 
 
 
485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1584  GTP-binding proten HflX  38 
 
 
434 aa  190  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2747  GTP-binding proten HflX  34.67 
 
 
419 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  38.07 
 
 
442 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1916  GTP-binding protein  33.94 
 
 
401 aa  189  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328695  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1857  GTPase  39.75 
 
 
433 aa  189  8e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.622907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  37.14 
 
 
512 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  36.02 
 
 
501 aa  187  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  36.96 
 
 
441 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  34.8 
 
 
435 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0033  GTP-binding proten HflX  35.12 
 
 
403 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00542605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  39.16 
 
 
503 aa  186  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  35.7 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1605  GTP1/OBG protein  33.43 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  33.48 
 
 
474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0036  small GTP-binding protein  35.96 
 
 
381 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1623  GTP-binding proten HflX  34.06 
 
 
408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  36.01 
 
 
444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1506  GTP-binding proten HflX  36.32 
 
 
433 aa  183  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00115562  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  35.89 
 
 
441 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  34.69 
 
 
512 aa  182  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  36.41 
 
 
450 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  36.67 
 
 
450 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  32.44 
 
 
421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1922  GTPase  36.26 
 
 
375 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.321489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  35.38 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  35.44 
 
 
406 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  36.9 
 
 
517 aa  178  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  35.32 
 
 
493 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  35.16 
 
 
420 aa  177  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  34.72 
 
 
441 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  37.19 
 
 
512 aa  176  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2724  GTP-binding proten HflX  36.01 
 
 
530 aa  176  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  37.4 
 
 
493 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  36.19 
 
 
521 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.54 
 
 
486 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2232  GTP-binding proten HflX  34.64 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  34.34 
 
 
414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  36.04 
 
 
420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3734  GTP-binding protein  37.93 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3553  GTP-binding protein  37.93 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1232  hypothetical protein  35.33 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.125901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  35.22 
 
 
429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1499  GTP-binding protein  34.4 
 
 
425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3806  GTP-binding protein  37.93 
 
 
425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2384  small GTP-binding protein  38.66 
 
 
420 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.740042  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  34.37 
 
 
509 aa  173  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3452  GTP-binding protein (hflX)  37.93 
 
 
425 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3716  GTP-binding protein  37.93 
 
 
425 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1723499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3241  GTP-binding proten HflX  36.59 
 
 
447 aa  173  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  36.06 
 
 
502 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  36.67 
 
 
451 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  34.62 
 
 
440 aa  172  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  34.1 
 
 
494 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3757  GTP-binding protein  37.62 
 
 
425 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00868177  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  35.19 
 
 
489 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  34.93 
 
 
505 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3472  GTP1/OBG protein  33.93 
 
 
423 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0294358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>