More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1245 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1245  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 142 aa  277  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.331226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1812  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3344  transcriptional regulator, MarR family  51.72 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0667  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.44 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3443  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3444  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  35.09 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  36.44 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  33.63 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  50.77 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  35.9 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  42.22 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  41.54 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1931  transcriptional regulator, ArsR family  31.48 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  36.21 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  43.94 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3777  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1527  regulatory protein ArsR  34.29 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0821  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0315  ArsR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0532  arsenical resistence operon repressor  33.64 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0160  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.94 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.571922  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1602  regulatory protein ArsR  35.94 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.10653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  52 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0302  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.94 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  33.6 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  44.62 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1708  ArsR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00199719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  45.1 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  35.8 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2209  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000625729  normal  0.041755 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  32.69 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35130  arsenic resistance transcriptional regulator  41.54 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.362165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  30.38 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  35.06 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  31.25 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3077  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1504  regulatory protein, ArsR  36.9 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14690  regulatory protein ArsR  25 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.27611e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  38.3 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 114 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  31.43 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  41.54 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  34.78 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.29 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1729  ArsR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.618601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.29 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 317 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1407  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.29 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  35.29 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  34.57 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>