More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0889 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0889  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 142 aa  282  9e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1446  transcriptional regulator, AsnC family  77.46 
 
 		 142 aa  226  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2379  transcriptional regulator, AsnC family  75.35 
 
 		 142 aa  220  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2162  transcriptional regulator, AsnC family  73.94 
 
 		 142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2846  transcriptional regulator, AsnC family  69.72 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00639698  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  41.79 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 167 aa  84  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.03 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  25.74 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.15 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.33 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.03 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.84 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  37.9 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  32.82 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 140 aa  67  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.03 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  36.52 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  29.37 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.03 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.03 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.23 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  29.46 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.23 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.23 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  32.12 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.23 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.51 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.03 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.69 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.75 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.66 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.75 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30.08 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.1 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  30.13 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  30.13 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.1 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  30.13 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  30.13 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  30.13 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.93 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  30.13 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4110  putative transcriptional regulator, AsnC family  30.3 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.280532 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  29.55 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  28.79 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  28.06 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  28.06 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  33.91 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  25.19 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  30.58 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.1 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.1 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.1 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>