More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1359 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  60.7 
 
 
245 aa  246  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  51.69 
 
 
243 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  50.87 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  49.34 
 
 
240 aa  211  7e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  52.77 
 
 
250 aa  210  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  49.13 
 
 
240 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  48.47 
 
 
237 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  49.56 
 
 
248 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  49.36 
 
 
258 aa  201  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  48.5 
 
 
243 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  44.1 
 
 
241 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  43.64 
 
 
250 aa  190  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  41.3 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  42.17 
 
 
238 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  45.89 
 
 
233 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  47.5 
 
 
243 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  47.2 
 
 
240 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  45.96 
 
 
240 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  38.5 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  41.01 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  39.52 
 
 
236 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  40.59 
 
 
238 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  34.87 
 
 
258 aa  111  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  37.19 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  39.91 
 
 
235 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  36.32 
 
 
239 aa  105  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 
249 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  35.2 
 
 
246 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  39.41 
 
 
238 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  41.67 
 
 
261 aa  95.1  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  36.75 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  39.86 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  36.25 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  35.08 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  39.39 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  35.12 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  32.56 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  37.23 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  35.94 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  30.43 
 
 
232 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  35.29 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  38.65 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  40.36 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  36.42 
 
 
237 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  36.42 
 
 
237 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  38.92 
 
 
247 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  38.41 
 
 
243 aa  89  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  43.9 
 
 
222 aa  89  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  33.12 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  35.97 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  33.12 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  35.48 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  38.73 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  40.71 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  33.16 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  37.93 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  40.65 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  35.85 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  37.25 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  35.67 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3577  glutamine amidotransferase class I  35.98 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  38.36 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  35.24 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  35.09 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  35.37 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  37.09 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  37.14 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  33.55 
 
 
513 aa  82  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  42.66 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  34.81 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  35.67 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3197  glutamine amidotransferase  36.6 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  31.45 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  33.13 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  35.71 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  36.73 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  36.73 
 
 
513 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42180  hypothetical protein  34.15 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1249  glutamine amidotransferase class-I  26.92 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.762989  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  34.21 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  37.24 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  33.13 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  35.03 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0770  glutamine amidotransferase class I  33.33 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  35.14 
 
 
510 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1393  glutamine amidotransferase class-I  27.04 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  36.97 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  35.57 
 
 
511 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0376  glutamine amidotransferase class-I  29.56 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  35.26 
 
 
512 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2020  glutamine amidotransferase class-I  29.56 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  36.11 
 
 
264 aa  75.1  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  37.41 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1842  glutamine amidotransferase  37.41 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.277756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  37.5 
 
 
516 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2971  glutamine amidotransferase  35.86 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1310  class I glutamine amidotransferase  26.67 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000242298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0721  glutamine amidotransferase class-I  31.43 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.31334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>